Ocena kliniczna szybkiego testu RNA na Covid-19 (CERrnaTc-19)

Szybka, dokładna diagnoza Covid-19 znacznie pomogłaby w poprawie postępowania klinicznego z pacjentami z objawami możliwego Covid-19. Obecnie na wyniki standardowego testu na obecność wirusa trzeba czekać 2-3 dni. Instytut Inżynierii Biomedycznej Uniwersytetu Oksfordzkiego opracował nowy test, który może dać wyniki w 30 minut. Wykorzystuje się do tego wymaz z nosa/gardła, tak jak w obecnym teście standardowym.

W pierwszej fazie badania wymaz przesłano do laboratorium w suchej probówce. W laboratorium wymaz umieszczano w fiolce z 1 ml wody, a niewielką ilość (25 µl) wody umieszczano w probówce. Ta probówka zawierała materiały, które mogą wykryć obecność nowego koronawirusa (SARS-CoV-2). Probówka jest następnie po prostu podgrzewana do 65°C przez 30 minut, a jeśli koronawirus jest obecny, odczynnik zmieni kolor z różowego na żółty (pozytywny). Jeśli w próbce nie ma wirusa, kolor pozostaje różowy (negatywny). Ma to być bardzo prosty test, który nie wymaga specjalistycznych umiejętności ani sprzętu, dzięki czemu może być przeprowadzany w szpitalach, a nawet w podstawowej opiece zdrowotnej. W tym badaniu chcieliśmy ocenić dokładność tego nowego testu. Planowaliśmy pobrać drugi wymaz od pacjentów z podejrzeniem Covid-19 w szpitalu Watford General (którzy i tak byli badani) i użyć tych wymazów do przeprowadzenia nowego testu (w idealnych warunkach laboratoryjnych) oraz standardowego testu. Ponieważ nie byliśmy pewni dokładności nowego testu, jego wyniki nie zostały wykorzystane do podjęcia decyzji o leczeniu pacjentki. W początkowej kohorcie 173 pacjentów odnotowano rozbieżności w przypadku niektórych próbek w porównaniu z wynikami laboratorium referencyjnego. Następnie zbadaliśmy, czy pacjenci, którzy mieli pozytywny szybki test RNA, ale negatywny test „złotego standardu”, byli prawdziwie pozytywni, zapraszając ich na test na obecność przeciwciał. To ujawniło, że 20 ze 161 pacjentów z ujemnym testem referencyjnym miało fałszywie dodatni wynik szybkiego testu. Te fałszywe alarmy mogą wynikać z substancji zakłócających w próbkach klinicznych, które wpływają na wykrywanie kolorymetryczne na podstawie zmian pH.

W związku z tymi pierwszymi wynikami i opiniami zespół z Oksfordu dokonał kilku modyfikacji w szybkim teście:

1. Inaktywacja wirusów – wymazówka jest umieszczana w soli fizjologicznej i podgrzewana w temperaturze 95°C przez 5 minut – co zabija wirusa i sprawia, że ​​można jej bezpiecznie używać w miejscu opieki
2. Próbkę rozcieńcza się w stosunku 1 do 10, aby uniknąć interakcji ze śliną
3. Dodano „przełącznik molekularny”, aby uniknąć fałszywych alarmów.

Następnie oceniono dokładność diagnostyczną zmodyfikowanego testu. Zaprosiliśmy pacjentów poddawanych badaniom przesiewowym oraz pacjentów, którzy zostali poddani badaniu przesiewowemu i uzyskali wynik pozytywny, do wzięcia udziału w tym badaniu. Ponieważ częstość występowania COVID-19 wśród badanych pacjentów była niższa niż szacowaliśmy podczas obliczania wielkości próby (tylko 12 ze 173 było pozytywnych w teście referencyjnym), próba została powiększona o kolejnych 300 pacjentów. Naszym celem było szybkie odkrycie, czy zmodyfikowany test jest dokładny.

Szybki test RNA może stać się użytecznym narzędziem przesiewowym, jeśli uzyska porównywalną czułość do obecnego „złotego standardu” przy szybkim i wykonalnym podejściu.