Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Frameshift Peptidy dětí s NF1

29. srpna 2022 aktualizováno: Roger Packer, Children's National Research Institute

Frameshift Peptidy u dětí s neurofibromatózou typu 1 (NF1) a buď gliomy nízkého stupně, nebo plexiformními neurofibromy

Cílem této studie je zjistit, zda děti a mladí dospělí s neurofibromatózou typu 1 (NF1) a buď gliomy nízkého stupně (LGG) nebo plexiformními neurofibromy (PN) mají specifický peptidový proteinový profil posunu rámce a zda byla vytvořena vakcína specifická pro onemocnění tyto mutace a varianty s posunem rámce mohou být vyvinuty. Budou analyzovány tři studované populace; pacientů s NF1 a aktivními LGG, NF1 a aktivními PN a NF1 a žádný důkaz aktivních LGG nebo PN. Účast zahrnuje jednorázový odběr krve.

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Detailní popis

I. Cíle a specifické cíle

A. Cíle:

Zjistit, zda děti a mladí dospělí s NF1 a buď gliomy nízkého stupně (LGG) nebo plexiformními neurofibromy (PN) mají specifický peptidový proteinový profil posunu čtecího rámce a zda lze vyvinout vakcínu specifickou pro onemocnění vytvořenou pro řešení těchto posunových mutací a variant.

B. Primární cíle:

  1. Určete profil peptidového posunu čtecího rámce u dětí a mladých dospělých s NF1 a aktivními LGG, NF1 a aktivními PN a NF1 a bez známek aktivních LGG nebo PN.
  2. Určete, zda se peptidové profily posunu čtecího rámce u dětí a mladých dospělých s NF1 v každé ze sledovaných populací liší.
  3. Zjistěte, zda lze specifické peptidové profily posunu rámce použít k vytvoření vakcíny specifické pro onemocnění pro děti a mladé dospělé s NF1 a buď LGG nebo PN.

C. Sekundární cíle:

  1. Posoudit vliv věku, pohlaví, rodinné anamnézy NF, stavu onemocnění (stabilního, progresivního nebo reagujícího) a léčby na peptidové profily s posunem čtecího rámce u dětí a mladých dospělých s NF1 a aktivními LGG nebo PN.
  2. Posoudit dopad typu mutace NF1 na nalezené profily peptidu posunu čtecího rámce.

II. Pozadí

A. Neurofibromatóza typu 1

Neurofibromatóza typu I (NF1) je genetická porucha, která postihuje 1 z 3000 jedinců způsobená zárodečnou heterozygotní mutací genu NF1 umístěného na chromozomu 17. Mutace se dědí jako autozomálně dominantní gen, je 100% penetrantní a projevuje se četnými komplikacemi, z nichž mnohé mohou významně inhibovat schopnost jedince fungovat v každodenním životě a v některých případech mohou být život ohrožující (Viskochil et al., 1990, Wallace a kol., 1990). Dosud byla vytvořena pouze proměnná asociace mezi typem přítomné mutace a fenotypem postiženého jedince. Některé projevy NF1, jako jsou skvrny café au lait a dermální fibromy, jsou extrémně časté, zatímco jiné, i když méně časté, mohou způsobit těžkou neurologickou nebo jinou orgánovou dysfunkci (Ferner et al., 2007). Dva z nejčastějších projevů souvisejících s NF1 jsou plexiformní neurofibromy a gliomy, zejména gliomy postihující zrakový systém. Léčba obou je v současnosti suboptimální, nicméně nové molekulárně cílené a imunologické přístupy slibují lepší výsledky (Khatua et al., 2018).

Gliomy se mohou vyvinout již v kojeneckém věku s počátečním vrcholem diagnózy ve věku 3 až 5 let (Schmandt & Packer, 2000, Khatua et al., 2018). V době klinické detekce se často vyskytuje významná morbidita spojená s nádorem, často vedoucí k nevratnému poškození zraku, které se může zhoršovat s progresí těchto nádorů zrakového nervu a chiasmatu. V současné době jsou k dispozici terapie, které zpomalují nebo zastaví růst těchto lézí; tyto terapie však často nezastaví ztrátu zraku, zřídka vedou ke zlepšení zraku a mohou mít pouze přechodný přínos. Gliomy mohou také vzniknout v různých oblastech mozku, zejména v mozkovém kmeni později v dětství a do rané dospělosti. Když se tyto nádory stanou aktivními u dospívajících nebo mladých dospělých, mohou zmutovat do agresivnějších anaplastických pilocytárních astrocytomů a stát se rezistentními vůči terapii. Tyto agresivnější gliomy jsou potenciální příčinou smrti u pacientů s NF1.

Plexiformní neurofibromy se mohou vyskytnout až u 60 % pacientů s NF1 s potenciálem vést k těžkému znetvoření a neurologickému ohrožení kompresí míchy nebo periferních nervů (Packer et al., 2018). V závislosti na lokalizaci mohou plexiformní neurofibromy také vést k závažnému respiračnímu ohrožení nebo urologické dysfunkci. Ačkoli se věří, že jde o vrozené projevy, mnohé z nich se nemusí stát zjevnými nebo symptomatickými až později v životě. Mezi 6-13 % plexiformních neurofibromů zmutuje do maligních lézí pochvy periferního nervu, které typicky špatně reagují na současné terapeutické možnosti a mohou mít za následek smrt.

Pacienti s NF1 mají zkrácenou očekávanou délku života ve srovnání s těmi, kteří nejsou částečně způsobeni ničivými plexiformními neurofibromy, maligními nádory pochvy periferních nervů a gliomy, které se u nich vyvíjejí (Packer et al., 2018). Klinicky důležitou otázkou u pacientů s NF1 je, zda diagnostika a léčba začínajících nádorů povede k lepším výsledkům a sníží pravděpodobnost maligní progrese těchto nádorů. Nedávné pokroky v zobrazování a zpracování obrazu zlepšily přesnost a detaily vizualizace rostoucí nádorové hmoty, nicméně ideální by bylo vyvinout krevní test schopný indikovat stav těchto dětí NF1. Včasné intervence s lepší léčbou se mohou ukázat jako účinnější a méně škodlivé pro pacienta než agresivnější léčba potřebná v pozdější fázi onemocnění. Navíc léčba imunoterapeutickými přístupy, zejména vývoj vakcíny k prevenci výskytu nebo progrese gliomů a plexiformních neurofibromů, je potenciálně funkci zachraňující a život zachraňující intervence.

III. Metody

Každý přihlášený účastník podstoupí jednorázový odběr krve do 10 ml. Studijní místa také získají základní demografické a klinické informace.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

60

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

    • District of Columbia
      • Washington, District of Columbia, Spojené státy, 20010
        • Children's National Medical Center
    • Georgia
      • Atlanta, Georgia, Spojené státy, 30322
        • Emory University
    • Texas
      • Dallas, Texas, Spojené státy, 75390-9020
        • The University of Texas Southwestern Medical Center

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

3 roky až 26 let (Dítě, Dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Do studie bude zařazeno celkem 60 pacientů. Skupinu 1 bude tvořit 20 subjektů s NF1 a aktivním LGG. Kohorta 2 se bude skládat z 20 subjektů s NF1 a aktivní PN. Kohorta 3 se bude skládat z 20 subjektů s NF1 a bez aktivního LGG nebo aktivní PN.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  1. Subjekty musí být ve věku od 1 dne do 30 let včetně
  2. Subjekty musí buď splňovat klinická kritéria pro NF1, nebo mít průkaz NF1 molekulárně genetické zárodečné linie
  3. Subjekt si může nechat odebrat vzorek krve v přiměřené době po podpisu souhlasu
  4. Předměty musí mít buď:

    1. Aktivní* LGG, žádné aktivní PN (Kohorta 1)
    2. Aktivní* PN, žádné aktivní LGG (Kohorta 2)
    3. Žádné aktivní* LGG nebo PN (Kohorta 3) *Aktivní je definováno jako jakékoli LGG nebo PN, které za posledních 12 měsíců vykazovalo růst (určeno pomocí MRI) nebo způsobuje pokračující symptomatickou zrakovou, neurologickou nebo orgánovou dysfunkci nebo znetvoření, jak je určeno vyšetřovatel lokality.

Kritéria vyloučení:

1. Pacienti s NF1 s průkazem LGG i PN

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Kohorta
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Pacienti s NF1 a aktivními LGG
Pacienti s neurofibromatózou typu 1 s klinickým nebo rentgenovým průkazem gliomu nízkého stupně, ale bez klinického nebo radiografického průkazu plexiformního neurofibromu.
Vzorky krevních testů pacientů budou odebrány a vyhodnoceny na peptidové mutace s posunem čtecího rámce.
Pacienti s NF1 a aktivními PN
Pacienti s neurofibromatózou typu 1 s klinickým nebo rentgenovým průkazem plexiformního neurofibromu, ale bez klinického nebo radiografického průkazu gliomu nízkého stupně.
Vzorky krevních testů pacientů budou odebrány a vyhodnoceny na peptidové mutace s posunem čtecího rámce.
Pacienti s NF1 bez aktivních LGG nebo PN
Pacienti s neurofibromatózou typu 1 bez klinických nebo rentgenových důkazů aktivního plexiformního neurofibromu a aktivního gliomu nízkého stupně.
Vzorky krevních testů pacientů budou odebrány a vyhodnoceny na peptidové mutace s posunem čtecího rámce.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Změřte průměrnou intenzitu fluorescence vzorků séra/plazmy pro každou kohortu testováním studijních vzorků na peptidových polích s posunem čtecího rámce sestávajících z peptidů představujících ~220 000 posunů čtecího rámce, které mohou nádory vytvořit při zpracování RNA.
Časové okno: 2 roky
Všechny vzorky budou testovány na FSP čipech sestávajících z peptidů představujících posuny rámců, které mohou nádory vytvořit při zpracování RNA. Množství IgG navázaného na každý znak bude určeno jako intenzita fluorescence generovaná navázanou sekundární protilátkou. Bude stanovena průměrná intenzita napříč 20 subjekty pro každý peptid pro každou ze 3 skupin. Budou stanoveny všechny peptidy ve skupině NF1+LGG se středními intenzitami vyššími než 3 SD vyšší než průměr skupiny NF1-LGG/PN. Budou vybráni ti, kteří toto kritérium splňují ve více než 3 z 20 vzorků. Pro vakcínu bude vybráno 20 peptidů s nejvyšší prevalencí ve 20 vzorcích NF1+LGG. Pokud mají dva peptidy stejnou prevalenci, bude vybrán ten s nejvyšší průměrnou fluorescencí. Stejný postup bude použit pro stanovení 20 peptidových složek pro vakcínu NF1+PN.
2 roky
Použijte metodu počítání znaků ke stanovení průměrného rozlišitelného peptidového proteinového profilu posunu rámce pro časnou detekci nádorů u pacientů s NF1.
Časové okno: 2 roky
Stejná data jako ve výsledku 1 budou analyzována pro schopnost odlišit vzorky NF1+LGG a NF1+PN od vzorků NF1-LGG/PN. Protože protilátkové reakce na peptidy s posunem čtecího rámce jsou stochastické, používá se metoda počítání znaků. Pro každý z NF1-LGG/PN peptidů je stanoven průměr. Jakýkoli peptid ve vzorcích NF1+LGG a NF1+PN, který má skóre o 3 SD vyšší než průměr NF1-LGG/PN, je hodnocen jako pozitivní. Celkový počet kladných hodnot v souboru NF1+LGG a NF1+PN bude porovnán s počtem v souboru NF1-LGG/PN. Počet vzorků, které se odlišují těmito počty, určí odhad přesnosti prvního průchodu tohoto diagnostického přístupu jako preambuli rozšířené studie.
2 roky
Použijte metodu počítání znaků ke stanovení průměrného rozlišitelného peptidového proteinového profilu posunu rámce pro pacienty, u kterých se rozvinou LGG, oproti pacientům, u kterých se rozvinou PN.
Časové okno: 2 roky
Budou použita stejná data pole vygenerovaná ve výsledku 1. Metoda počítání prvků použitá v Outcome 2 bude použita k porovnání funkcí NF1+LGG s vlastnostmi NF1+PN. Vyšetřovatelé určí, zda existuje soubor vlastností, které dokážou odlišit vzorky 20 NF1+LGG od vzorků 20 NF1+PN. Počet vzorků NF1+LGG a NF1+PN, které lze rozlišit, poskytne první odhad přesnosti a toho, zda je vhodná rozšířená studie.
2 roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Korelujte věk, pohlaví, rodinnou anamnézu NF, stav onemocnění (stabilní, progresivní nebo zlepšující se) a historii onemocnění s peptidovými profily posunu čtecího rámce u dětí a mladých dospělých s NF1 a LGG nebo PN.
Časové okno: 2 roky
Korelujte věk, pohlaví, rodinnou anamnézu NF, stav onemocnění (stabilní, progresivní nebo zlepšující se) a historii onemocnění s peptidovými profily posunu čtecího rámce u dětí a mladých dospělých s NF1 a LGG nebo PN.
2 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Roger J. Packer, MD, Children's National Research Institute

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

11. dubna 2019

Primární dokončení (Aktuální)

27. dubna 2022

Dokončení studie (Aktuální)

27. dubna 2022

Termíny zápisu do studia

První předloženo

1. května 2019

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

26. prosince 2019

První zveřejněno (Aktuální)

27. prosince 2019

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

31. srpna 2022

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

29. srpna 2022

Naposledy ověřeno

1. srpna 2022

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

Ne

Popis plánu IPD

Neexistuje žádný plán zpřístupnit data jednotlivých účastníků dalším výzkumníkům mimo Dětské národní lékařské centrum.

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Neurofibromatóza typu 1

Klinické studie na Test vzorku krve Frameshift Array

Předplatit