Smíšený molekulární klinický index (MMCI) u difuzního velkobuněčného B-lymfomu (DLBCL) (MMCI)

Difuzní velkobuněčný B-lymfom (DLBCL) je heterogenní skupina rakovin klasifikovaných společně na základě morfologie, imunofenotypu, genetických změn a klinického chování. Rozlišení DLBCL do kategorií původu buněk (COO) na základě vzorců genové exprese připomínající (B-buňka zárodečného centra - skupina GC a aktivovaná B-buňka - skupina ABC-), jak je definován a charakterizován lymfomem & Leukemia Molecular Profiling Project (LLMPP) má hluboké biologické, prognostické a potenciální terapeutické důsledky a v závislosti na negativním prognostickém účinku onkogenu myelocytomatózy (MYC), B-buněčného lymfomu 2 (BCL2) a B-buněčného lymfomu-6 (BCL6). ) změny v DLBCL se ukázaly do značné míry závislé na podtypech COO . Navíc kombinace změn BCL2, MYC a BCL6 s IPI (International Prognostic Index) identifikuje výrazně horší prognostické skupiny v rámci jednotlivých subtypů COO. Původní metody používané k definování těchto entit prováděly profilování genové exprese (GEP) pomocí mikročipů na RNA odvozené ze zmrazené tkáně (FT). Následně při pokusu o stanovení COO ve standardní praxi pomocí běžně dostupných formalínem fixovaných tkání zalitých v parafinu (FFPE) byly použity méně přesné, ale relativně levné binární imunohistochemické (IHC) metody. Avšak zejména u non GC byla míra shody neuspokojivá. Místo toho byl demonstrován vysoký stupeň shody při určování COO, s podpisem 20 genů ze vzorků tumorů zalitých ve formalínu fixovaném v parafínu (FFPE), se soupravou Lymph2Cx (nCounter® Technology, NanoString Technologies), která se stala zlatým standardem navrhovaným ve světě Klasifikace zdravotnické organizace (WHO) . Nedávno však bylo prokázáno, že stavy COO a BCL2, MYC, BCL6 nestačí k popisu molekulárního rizika těchto pacientů, což naznačuje genetickou substrukturu, kterou je třeba ještě objevit. Prognostickou roli v DLBCL má navíc nádorové mikroprostředí a zejména poměr imunitních efektorů a kontrolních molekul. Kromě toho zvýšená frekvence myofibroblastů, dendritických buněk a shluků T buněk pozitivních na diferenciaci 4 (CD4) korelovala s lepšími výsledky.

Závěrem lze říci, že komplexní genomická analýza těchto pacientů a hluboká charakterizace imunitního kompartmentu a imunitních kontrolních bodů (Nanostring, imunohistochemie pro BCL2, MYC, BCL6, mutační analýza, proteomická analýza atd.) ve spojení s IPI skóre umožní vytvoření smíšený, molekulární, klinický index (MMCI) k identifikaci extrémně špatných prognostických skupin v rámci každého podtypu COO, aby bylo možné v budoucnu zvážit léčbu přizpůsobenou riziku.

Jde o prospektivní observační studii s celkovou dobou trvání 36 měsíců. Primárním cílem je identifikace nových prognostických biomarkerů pro pacienty s DLBCL ve smyslu přežití bez progrese (PFS) a schopných přidat prediktivní kapacitu k uznávaným důležitým klinickým faktorům.

Sekundární cíle jsou:

• identifikovat nové biomarkery spojené s celkovým přežitím (OS) a mírou objektivní odpovědi (ORR);
• charakterizovat tkáňové a cirkulující imunitní mikroprostředí pacientů s DLBCL pomocí hromadné a jednobuněčné transkriptomiky;
• posoudit korelaci mezi expresí imunitních kontrolních genů a podpisem mRNA;
• popsat mutační stav panelu genů relevantních pro patogenezi DLBCL;.
• pro posouzení korelace mezi proteinovou expresí, mutačním stavem a podpisem mRNA.

U každého zařazeného pacienta budou na každé patologické jednotce provedena imunohistochemická stanovení: COO (typ GC nebo ABC podle Hansova algoritmu), hodnocení CD20, CD5, CD10, Bcl6, Bcl2 (cut off>50 %), MUM1/IRF4, c-myc (cut off>40 %) a Ki67, FISH pro c-myc a pokud je přeskupeno, pro Bcl2 e Bcl6). Kromě toho budou odebrány vzorky nádorů zalitých v parafínu (FFPE) pro extrakci RNA a analýzu exprese mRNA a centralizovány na IRST-IRCCS.