Rychlé diagnostické profilování SARS-CoV-2 (COVID-19) (Profile-Cov)

V prosinci 2019 byl shluk pacientů s pneumonií neznámé etiologie spojen s infekcí novým koronavirem - SARS-CoV-2. Od té doby se infekce stala pandemií a rozšířila se téměř ve všech zemích světa. Znalost dynamiky viru a imunitní reakce hostitele na ni je nezbytná pro pochopení patogeneze i pro formulování diagnostických, terapeutických a preventivních strategií. Neexistují však žádné studie týkající se těchto problémů, zejména v kontextu subsaharské Afriky (SSA). Předchozí studie výzkumníků ukázaly, že imunitní profil zdravých Etiopanů vykazuje známky chronické imunitní aktivace s významnými nízko naivními buňkami, ale vysoce aktivovanými paměťovými buňkami, subpopulací CD4+ i CD8+ T-buněk. Výše uvedené charakteristiky imunitního systému Etiopanů ve srovnání s Evropany vedly výzkumníky k předpokladu, že by mohly přispět k patogenezi a závažnosti klinického projevu COVID-19. Přetrvávající imunitní aktivace v důsledku nepřetržitých infekcí helminty je běžná v celém regionu SSA. Taková aktivace obvykle vychýlí imunitní systém směrem k odpovědím typu T helper (Th)-2. Imunitní reakce proti SARS-CoV-2 je typicky takzvaná „cytokinová bouře“. Vyšetřovatelé zde předpokládají, že infekce SARS-CoV-2 indukovaná imunitní aktivací, jak je pozorována u pacientů v industrializovaném světě (se souběžnými bouřemi cytokinů a rozsáhlou nespecifickou cytotoxicitou CD8 T-buněk), může být významnější než u lidí ze SSA, a to kvůli k Th2 profilu jejich imunitního systému.

Vyšetřovatelé navrhují studovat profil imunitní odpovědi etiopské populace a prozkoumají její vztah se zaznamenaným nízkým počtem CD4+ T-buněk a základním stavem imunitní aktivace u pacientů s COVID-19 a porovnají výsledky s těmi, kteří pobývají v Evropě. Kromě toho bude tento projekt vyhodnocovat výkonnost různých rychlých diagnostických testů (RDT) na SARS-CoV-2 s přihlédnutím k výše stanoveným charakteristikám imunitního systému. Kromě toho vyšetřovatelé vyhodnotí RDT pro použití při screeningu infikovaných pacientů, kteří jsou asymptomatičtí, zejména ve zdravotnických zařízeních, a také pro monitorování obnovy nebo odstranění vylučování virů pro použití v prostředí s omezenými zdroji. Takové srovnávací studie pomohou identifikovat imunitní faktory, které by mohly hrát roli při zmírňování narušených imunitních reakcí způsobených infekcí SARS-CoV-2, a přispět tak k návrhu a vývoji účinné diagnostiky, terapie nebo vakcíny.

Patogeneze těžkého onemocnění COVID-19 souvisí s hyperzánětem. Symptomatologie COVID-19 v SSA se však zdá být výrazně méně závažná než v industrializovaném světě. Předpokládáme, že jedinci s bydlištěm v SSA a koinfikovaní střevními parazity snižují imunitu vůči SARS-CoV-2 a ztlumují závažnost COVID-19.