Optiset ja biokemialliset biomarkkerit varhaisessa haimasyövässä

Haimamehun keräys suoritetaan suonensisäisellä injektiolla FDA:n hyväksymää synteettistä ihmisen sekretiiniä (ChiRhoClin Inc., Burtonsville, MD) annoksella 0,2 ug/kg, kun endoskooppi on sijoitettu pohjukaissuolen toiseen osaan. Pohjukaissuolesta ja ilman Vaterin papillan kanylointia 2,3 mm:n muovinen aspiraatiokatetri (Olympus, Tokio, Japani) viedään endoskoopin biopsiakanavan läpi, kunnes se näkyy endoskooppisen monitorin näytöllä. Kun aktiivinen näkyvä eritys papillan kautta on alkanut, ensimmäiset 10 ml haimamehua kerätään imemällä. Tämä koko prosessi sekretiiniinjektiosta näytteenottoon kestää keskimäärin 5 minuuttia. Näyte jaetaan sitten 2 ml:n ampulleihin, jotka pikapakastetaan nestetypessä (tai kannettavassa pikapakastuspakastimessa) ja säilytetään pakastimessa, kunnes määritykset suoritetaan. Tässä tutkimuksessa arvioidaan 10 parasta ehdokasmarkkeria, jotka on saatu kudoksen löytämisestä ja validoinnista (AUC > 0,95) ja pilottihaimamehutestauksesta (AUC > 0,9). Kun DNA on uutettu 0,4 ml:sta haimamehua, se käsitellään bisulfiitilla optimoituja menetelmiä käyttäen. Sitten suoritetaan kohdegeenien poikkeavan metylaation määritys käyttämällä QuARTS-tekniikkaa. Tulokset normalisoidaan joko ihmisen DNA-markkeriin (esim. beeta-aktiini) tai metyloituun DNA-markkeriin, joka on tunnistettu normaalille haiman epiteelille.