DÉPISTAGE ET SÉROÉPIDÉMIOLOGIE DE L'INFECTION À SARS-CoV-2 À L'UNIVERSITÉ DE BARCELONE : UNE ÉTUDE TRANSVERSALE (UB-GTMS-COVID)

CONTEXTE : Le 7 janvier 2020, les autorités chinoises ont identifié comme agent responsable des cas de pneumonie atypique d'étiologie inconnue un nouveau type de virus de la famille des Coronaviridae qui a par la suite été nommé SARS-CoV-2, dont la séquence génétique a été partagée par les autorités chinoises le 12 janvier (identifiant de taxonomie : 2697049).

Le 30 janvier 2020, le directeur général de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), suivant l'avis du Comité d'urgence convoqué conformément au Règlement sanitaire international (2005), a déclaré que l'épidémie de COVID-19 avait commencé à Wuhan, en Chine, en décembre 2019, étant une urgence de santé publique de portée internationale. Le 11 mars, l'OMS a déclaré la pandémie mondiale de SRAS-CoV-2.

Jusqu'à présent, en l'absence de vaccins ou d'antiviraux efficaces, les efforts se sont concentrés sur l'identification des cas et de leurs contacts. Les cas et leurs contacts sont isolés pendant environ 14 jours dans le but de minimiser la propagation de cette infection et d'éviter une augmentation du nombre de personnes touchées.

Au niveau de la pratique clinique microbiologique, le diagnostic d'infection par le SRAS-CoV-2 peut être posé par :

1. Détection de la présence des séquences d'acides nucléiques cibles dans l'ARN du SRAS-CoV-2 (gène RdRP du SARSCoV-2 et gène N et Orf1ab présents dans le SRAS et le SARSCoV-2, gène E du SRAS) dans l'échantillon du patient par reverse réaction en chaîne par polymérase transcriptase (RT-PCR).
2. Détection des anticorps : immunoglobulines totales et IgG.

Au moment de la rédaction de cette nouvelle version du protocole, le pays est plongé dans la deuxième vague de la pandémie de COVID-19. Les projections de l'histoire naturelle de la maladie et les estimations d'infections possibles par le SRAS-CoV-2, réalisées à la fin de la première vague, ont permis de déterminer la faisabilité de cette deuxième vague avec l'apparition du froid dès le automne. Certains des facteurs qui ont soutenu cette hypothèse sont:

1. À la fin de la première vague, l'immunité collective contre le virus n'était pas atteinte. Les résultats de l'étude ENE-COVID, publiés dans le magazine Lancet en juillet de cette année, ont indiqué que dans notre environnement, seuls 6 % ont atteint l'immunité.
2. De nombreux virus respiratoires ont un comportement saisonnier et leur circulation augmente pendant les mois d'automne et d'hiver. C'est pourquoi un comportement similaire a été supposé chez ce nouveau virus SARS-CoV-2, connaissant une plus grande transmissibilité avec la baisse de température et l'augmentation de l'humidité, typiques des périodes hivernales.
3. En observant l'évolution de la grippe pandémique de 1918, la première vague a eu lieu en 1918, mais elle a été suivie d'une deuxième et d'une troisième vague, en 1919 et 1920 respectivement. Cependant, la deuxième vague a présenté la particularité d'être déclenchée dans d'autres zones où la première vague n'avait pas été aussi intense.

Compte tenu de ce scénario, l'Université de Barcelone, en collaboration avec la Gerencia Territorial del Área Metropolitana Sud, a prévu de réaliser une étude de séroprévalence et de dépistage du SRAS-CoV-2 dans la population des utilisateurs de l'UB. Les résultats de cette étude permettront de prendre des décisions préventives face à l'infection par le SARS-CoV-2 à l'UB, en lien avec ses activités pédagogiques et administratives. De plus, cette étude transversale peut servir d'étude de base pour une future étude de suivi.

HYPOTHÈSE : L'incidence de l'infection par le SRAS-CoV-2 dans le groupe d'étudiants et de travailleurs de l'Université de Barcelone est similaire à l'incidence dans la population générale.

La séroprévalence de l'infection par le SRAS-CoV-2 dans le groupe d'étudiants et de travailleurs de l'Université de Barcelone est similaire à la séroprévalence de la population générale.

OBJECTIF PRINCIPAL

• Estimer l'incidence de l'infection par le SRAS-CoV-2 dans la communauté UB.
• Estimer l'infection de séroprévalence SARS-CoV-2 dans la communauté UB.

OBJECTIFS SECONDAIRES

Objectifs cliniques :

• Estimer les facteurs associés à l'incidence dans la communauté UB.
• Estimer les facteurs associés à la séroprévalence dans la communauté UB

CONCEPTION DE L'ÉTUDE Étude transversale avec des informations épidémiologiques pour déterminer l'incidence et la prévalence de l'infection par le SRAS-CoV-2 dans la population UB, par PCR et tests sérologiques pour détecter les anticorps.