Vurdering av blodbiomarkører av DNA-mikroarrays hos pasienter med aggressivt lymfom BMS_LyTrans (BMS-LyTrans)

To komplementære tilnærminger vil bli fulgt, en på transkriptomisk nivå for bekreftelse av diagnostiske biomarkører og for å vurdere for prediktive biomarkører. Den andre gjelder biologiske studier for å validere våre biomarkører på vevsnivå. Prosjektet vårt vil bli organisert rundt 4 arbeidspakker (WP), hver av dem inkluderer oppgaver med en spesifikk tidsplan og forhåndsdefinerte leveranser. Den første gjelder generell ledelse, datavarehus, samlinger og ulike administrative og preanalytiske problemstillinger. De 3 andre WP-ene er vitenskapelige. Vi skal først validere en 30-geners liste, kandidatdiagnostiske biomarkører, ved qRT-PCR på: *) et uavhengig sett med DLBCL sammenlignet med matchede friske blodgivere (sensitivitetsvurdering) og, **) på en serie med lav tumor belastnings-DLBCL, mantelcellelymfomer og ikke-malign inflammatorisk sykdom som utgjøres av pasienter med et septisk sjokk (spesifisitetsvurdering). Alle disse sistnevnte samlingene er allerede tilgjengelige og klare til bruk. For det andre vil vi fullføre serien vår på 89 hybridiserte pasienter på AFFY WholeExon mikroarrayer med 60 supplerende og tilgjengelige prøver for å vurdere for molekylær prediktor for pasientutfall. Dette spørsmålet vil bli adressert basert på 3- og 5-års også, EFS (Event Free Survivor). Alle kliniske data er tilgjengelige gjennom GOELAMS eCRF. Siden vi disponerer 31 probesetter, 30 enkeltgener, signatur for DLBCL-diagnosen som involverer 9 gener relatert til myeloidrommet, inkludert 6 gener involvert direkte eller ikke til Myeloid-Derived Cell Suppression (MDSC) prosessen, 20 gener beskrevet i konteksten av kreften og 11 gener knyttet til endotelceller, bestemte vi oss for å utforske blodsirkulerende celler ved hjelp av flowcytometri. Vi vil se etter myeloide populasjoner og subpopulasjoner, endotelceller og mikropartikler. Målet er identifisering av spesifikke MDSC-forstyrrelser, angiogene abnormiteter og funksjonelle påvirkninger på immunresponsen i sammenheng med kreften.

Vi forventer gjennom vårt arbeid å drive både grunnleggende vitenskap og kliniske implikasjoner. På det vitenskapelige nivået bærer blod molekylære og cellulære komponenter involvert i tumor-vert-interaksjoner. Prosjektet vårt skal gi en dypere forståelse av den immunologiske responsen som finner sted i blodrommet. Denne immunologiske responsen vil karakteriseres på et molekylært, cellulært og funksjonelt nivå. Fra et klinisk synspunkt kan det bringe en ny prognostisk modell i DLBCL. Siden blod er lett tilgjengelig, forventer vi at det lett kan implementeres i klinisk praksis og tillater utforming av nye kliniske studier stratifisert på tumorbiologiske egenskaper. Det kan også bli en ny måte å overvåke DLBCLs respons på behandlingen. Videre vil dette prosjektet gi en stor mengde molekylære data som enkelt kan kobles til andre pågående GOELAMS-studier. Valorisering av funnene våre vil også være et alvorlig problem siden prosjektet vårt er svært originalt og verdifullt.