Beoordeling van bloedbiomarkers door DNA-microarrays bij patiënten met agressief lymfoom BMS_LyTrans (BMS-LyTrans)

Er zullen twee complementaire benaderingen worden gevolgd, één op transcriptoomniveau voor bevestiging van diagnostische biomarkers en één voor het beoordelen van voorspellende biomarkers. De andere betreft biologische studies om onze biomarkers op weefselniveau te valideren. Ons project zal worden georganiseerd rond 4 werkpakketten (WP), elk met taken met een specifiek schema en vooraf gedefinieerde deliverables. De eerste betreft het algemeen beheer, datawarehouse, collecties en verschillende administratieve en preanalytische zaken. De 3 andere WP's zijn wetenschappelijk. We gaan eerst een lijst met 30 genen, kandidaat-diagnostische biomarkers, valideren door middel van qRT-PCR op: *) een onafhankelijke set DLBCL's vergeleken met gematchte gezonde bloeddonoren (gevoeligheidsbeoordeling) en, **) op een reeks lage tumor belasting DLBCL's, mantelcellymfomen en niet-kwaadaardige inflammatoire ziekte gevormd door patiënten met een septische shock (specificiteitsbeoordeling). Al deze laatste collecties zijn reeds beschikbaar en klaar voor gebruik. Ten tweede zullen we onze reeks van 89 gehybridiseerde patiënten op AFFY WholeExon-microarrays aanvullen met 60 aanvullende en beschikbare monsters om de moleculaire voorspeller van de patiëntuitkomst te beoordelen. Deze vraag zal worden beantwoord op basis van de 3-jarige en 5-jarige EFS (Event Free Survivor). Alle klinische gegevens zijn beschikbaar via de GOELAMS eCRF. Aangezien we beschikken over 31 probesets, 30 afzonderlijke genen, signatuur voor de DLBCL-diagnose waarbij 9 genen betrokken zijn die verband houden met het myeloïde compartiment, waaronder 6 genen die al dan niet direct betrokken zijn bij het Myeloid-Derived Cell Suppression (MDSC)-proces, 20 genen beschreven in de context van de kanker en, 11 genen die verbonden zijn met endotheelcellen, hebben we besloten om door flowcytometrie bloedcirculerende cellen te onderzoeken. We gaan op zoek naar myeloïde populaties & subpopulaties, endotheelcellen en microdeeltjes. Het doel is de identificatie van specifieke MDSC-verstoringen, angiogene afwijkingen en functionele effecten op de immuunrespons in de context van de kanker.

We verwachten dat ons werk zowel fundamentele wetenschappelijke als klinische implicaties zal stimuleren. Op wetenschappelijk niveau bevat bloed moleculaire en cellulaire componenten die betrokken zijn bij tumor-gastheer-interacties. Ons project moet een dieper inzicht geven in de immunologische respons die plaatsvindt in het bloedcompartiment. Deze immunologische respons zal worden gekarakteriseerd op moleculair, cellulair en functioneel niveau. Vanuit klinisch oogpunt kan het een nieuw prognostisch model in DLBCL opleveren. Omdat bloed gemakkelijk toegankelijk is, verwachten we dat het gemakkelijk in de klinische praktijk kan worden geïmplementeerd en dat het ontwerp van nieuwe klinische onderzoeken mogelijk wordt, gestratificeerd op kenmerken van tumorbiologie. Het kan ook een nieuwe manier worden om de reactie van DLBCL op de behandeling te volgen. Bovendien zal dit project een grote hoeveelheid moleculaire gegevens opleveren die gemakkelijk kunnen worden gekoppeld aan andere lopende GOELAMS-onderzoeken. Valorisatie van onze bevindingen zal ook een serieus probleem zijn, aangezien ons project zeer origineel en waardevol is.