Оценка биомаркеров крови с помощью ДНК-микрочипов у пациентов с агрессивной лимфомой BMS_LyTrans (BMS-LyTrans)

Будут использованы два дополнительных подхода: один на транскриптомном уровне для подтверждения диагностических биомаркеров и для оценки прогностических биомаркеров. Другой касается биологических исследований для проверки наших биомаркеров на тканевом уровне. Наш проект будет организован вокруг 4 рабочих пакетов (WP), каждый из которых включает задачи с определенным графиком и заранее определенными результатами. Первый касается общего управления, хранилища данных, коллекций и различных административных и преаналитических вопросов. 3 других WP являются научными. Сначала мы собираемся проверить список из 30 генов, потенциальных диагностических биомаркеров, с помощью qRT-PCR на: *) независимом наборе DLBCL по сравнению с подобранными здоровыми донорами крови (оценка чувствительности) и, **) на серии низких бремя DLBCLs, мантийно-клеточные лимфомы и незлокачественные воспалительные заболевания, вызванные пациентами с септическим шоком (оценка специфичности). Все эти последние коллекции уже доступны и готовы к использованию. Во-вторых, мы завершим нашу серию из 89 гибридизированных пациентов на микроматрицах AFFY WholeExon 60 дополнительными и доступными образцами, чтобы оценить молекулярный предиктор исхода пациента. Этот вопрос будет решаться на основе 3-летней и 5-летней EFS (Event Free Survivor). Все клинические данные доступны через eCRF GOELAMS. Поскольку мы располагаем 31 набором зондов, 30 одиночными генами, сигнатурой для диагностики ДВККЛ, которая включает 9 генов, связанных с миелоидным компартментом, включая 6 генов, непосредственно или не вовлеченных в процесс подавления миелоидных клеток (MDSC), 20 генов описаны в В контексте рака и 11 генов, связанных с эндотелиальными клетками, мы решили исследовать с помощью проточной цитометрии циркулирующие в крови клетки. Мы будем искать миелоидные популяции и субпопуляции, эндотелиальные клетки и микрочастицы. Целью является идентификация специфических нарушений MDSC, ангиогенных аномалий и функциональных воздействий на иммунный ответ в контексте рака.

Мы ожидаем, что наша работа будет способствовать как фундаментальной науке, так и клиническому применению. На научном уровне кровь несет молекулярные и клеточные компоненты, участвующие во взаимодействиях опухоль-хозяин. Наш проект должен способствовать более глубокому пониманию иммунологического ответа, происходящего в кровяном русле. Этот иммунологический ответ будет характеризоваться на молекулярном, клеточном и функциональном уровне. С клинической точки зрения это может привести к новой прогностической модели ДВККЛ. Поскольку кровь легкодоступна, мы ожидаем, что ее будет легко внедрить в клиническую практику и позволит разработать новые клинические испытания, стратифицированные по биологическим особенностям опухоли. Это также может стать новым способом мониторинга реакции ДВККЛ на лечение. Кроме того, этот проект предоставит большой объем молекулярных данных, которые можно легко связать с другими текущими исследованиями GOELAMS. Оценка наших результатов также будет серьезной проблемой, поскольку наш проект очень оригинален и ценен.