Veren biomarkkerien arviointi DNA-mikrosiruilla potilailla, joilla on aggressiivinen lymfooma BMS_LyTrans (BMS-LyTrans)

Noudatetaan kahta toisiaan täydentävää lähestymistapaa, joista toinen on transkriptiotasolla diagnostisten biomarkkerien vahvistamiseksi ja ennustavien biomarkkerien arvioimiseksi. Toinen koskee biologisia tutkimuksia biomarkkereiden validoimiseksi kudostasolla. Projektimme järjestetään neljän työpaketin (WP) ympärille, joista jokainen sisältää tehtäviä tietyllä aikataululla ja ennalta määritellyt suoritukset. Ensimmäinen koskee yleistä hallintaa, tietovarastoa, kokoelmia sekä erilaisia ​​hallinnollisia ja esianalyyttisiä asioita. Kolme muuta työryhmää ovat tieteellisiä. Aiomme ensin validoida 30 geenin luettelon, ehdokas diagnostiset biomarkkerit, qRT-PCR:llä: *) riippumaton DLBCL-sarja verrattuna vastaaviin terveisiin verenluovuttajiin (herkkyysarviointi) ja **) sarjassa, jossa kasvain on alhainen. taakka DLBCL:t, vaippasolulymfoomit ja ei-pahanlaatuinen tulehdussairaus, joka muodostuu potilaista, joilla on septinen sokki (spesifisyyden arviointi). Kaikki nämä jälkimmäiset kokoelmat ovat jo saatavilla ja valmiina käyttöön. Toiseksi täydennämme 89 hybridisoidun potilaan sarjaamme AFFY WholeExon -mikrosiruissa 60 lisänäytteellä ja saatavilla olevalla näytteellä arvioidaksemme potilaan lopputuloksen molekyylien ennustajaa. Tätä kysymystä käsitellään myös 3- ja 5-vuotiaiden EFS:n (Event Free Survivor) perusteella. Kaikki kliiniset tiedot ovat saatavilla GOELAMS eCRF:n kautta. Koska meillä on käytössä 31 koetinta, 30 yksittäistä geeniä, allekirjoitus DLBCL-diagnoosille, joka sisältää 9 myeloidiosastoon liittyvää geeniä, mukaan lukien 6 geeniä, jotka liittyvät suoraan tai ei-myeloidiperäiseen solujen suppressioon (MDSC), 20 geeniä, jotka on kuvattu Syövän kontekstissa ja 11 endoteelisoluihin liittyvää geeniä päätimme tutkia virtaussytometrialla verenkierrossa olevia soluja. Etsimme myelooisia populaatioita ja alapopulaatioita, endoteelisoluja ja mikropartikkeleita. Tavoitteena on tunnistaa spesifiset MDSC-häiriöt, angiogeeniset poikkeavuudet ja toiminnalliset vaikutukset immuunivasteeseen syövän yhteydessä.

Odotamme työmme ohjaavan sekä perustieteellisiä että kliinisiä vaikutuksia. Tieteellisellä tasolla veri kantaa molekyyli- ja solukomponentteja, jotka ovat mukana kasvain-isäntävuorovaikutuksessa. Projektimme pitäisi tuoda syvempää ymmärrystä immunologisesta vasteesta, joka tapahtuu veriosastossa. Tämä immunologinen vaste karakterisoidaan molekyyli-, solu- ja toiminnallisella tasolla. Kliinisestä näkökulmasta se voi tuoda uuden prognostisen mallin DLBCL:ään. Koska veri on helposti saatavilla, odotamme sen olevan helppo ottaa käyttöön kliinisessä käytännössä ja mahdollistaa uusien kliinisten kokeiden suunnittelun kasvainbiologisten ominaisuuksien perusteella. Siitä voi myös tulla uusi tapa seurata DLBCL:n vastetta hoitoon. Lisäksi tämä projekti tarjoaa suuren määrän molekyylitietoa, joka voidaan helposti yhdistää muihin meneillään oleviin GOELAMS-tutkimuksiin. Löytöjemme arvostaminen on myös vakava ongelma, koska projektimme on erittäin omaperäinen ja arvokas.