Uusien biomarkkereiden ennustava rooli yliherkkien potilaiden säteilylle rintasyövässä (Biorisise) (BIORISE)

Säteilyn aiheuttamiin vasteisiin osallistuvat molekyylimekanismit ovat monimutkaisia, ja proteomisia lähestymistapoja voidaan käyttää ymmärtämään paremmin ionisoivan säteilyn kokonaisreaktioprosessia ja tunnistamaan mahdolliset radioherkkaiset ennustavat markkerit. Tähän saakka harvat julkaisut ovat käsitelleet säteilyherkkien potilaiden määrittämistä.

Aikaisempien tulosten ja säteilyn aiheuttaman myöhäisvaikutusmäärityksen positiivisen ennustearvon parantamisen perusteella kehitimme kvantitatiivisen proteomisen lähestymistavan ennustavien radiobiologisten markkerien tunnistamiseksi potilailla, joilla on vaikea toksisuus. Ensinnäkin neljä potilasta valittiin alhaisella RILA -arvolla edellä mainituista mahdollisista tutkimuksista. Kahdella potilaalla ei ollut myrkyllisyyttä vähintään neljä vuotta hoidon päättymisen jälkeen, kun taas kahdella muulla potilaalla kehittyi vakava toksisuus, joka on suurempi kuin luokka 2. T-lymfosyytit on eristetty kokoverestä ja puolet heistä on säteilytetty in vitro. Sitten se suoritti kvantitatiivisen proteomiikan työnkulun käyttämällä 8-plex ITRAQ -merkintää ja useiden fraktioiden jälkeen analyysin resoluution optimoimiseksi (Geeli-fraktiointi, jota seurasi nanoliquid-kromatografia), proteiinit tunnistettiin tandem-massaspektrometrialla (4800 plus Maldi tof/tof). Yli 1300 kokonaisproteiinia tunnistettiin suurella luottamuksella (95%, yksi ainutlaatuinen peptidi). 0 Gy: n kohdalla 135 proteiinia ekspressoitiin eri tavalla potilaiden välillä, joilla oli vaikea radiosta aiheuttama toksisuus. Säteilytetyissä T-lymfosyyteissä (8 Gy) 107 proteiinia ekspressoitiin eri tavalla potilaiden välillä, joilla oli vaikea radio-aiheuttama toksisuus. Niiden joukossa viisi proteiinia (AK2, adenylaattikinaasi 2; IDH2, isositraattidehydrogenaasi 2 (NADP+); Anks1, Anneksiini 1; APEX1, DNA- (apuriininen tai apyrimidiininen kohta) Lyaasi ja HSC70, Heat Shock 71 KDA), jolla on suurta proteiinin ekspressio-suhdetta (> 1 Kontrollit valittiin peräkkäistä validointia varten. Nämä proteiinit ovat mukana useissa mekanismeissa, mukaan lukien aineenvaihdunta ja energiantuotanto, apoptoosi, kalsiumin sitova proteiini ja DNA -vahingot. Nämä viisi proteiinia ovat tällä hetkellä patenttisovelluksen kohteena.

Sitten rekrytoidaan 10 muuta potilasta (5 potilasta, joilla oli luokka ≥ 2 rintafibroosi ja 5 potilasta, joilla ei ole toksisuutta), joilla oli alhainen RILA-arvo proteiinien ilmentymisen validoimiseksi länsimaisella bloottilla. Tulokset osoittivat, että kaikki proteiinit ekspressoitiin säteilytetyillä T-lymfosyyteillä potilailla, joilla oli vaikea toksisuus suhteellisesti potilaille, joilla ei ole toksisuutta.

Proteiinien ekspressiotason vahvistamiseksi säteilyn aiheuttamissa myöhäisvaikutusten potilaissa ja suorituskyvyn arvon, erityisesti positiivisen ennustestin määrittämiseksi, viiden proteiinin paneelin annostuksen annosteluun perustuvan verenkokeen, on välttämätöntä validoida nämä alustavat tulokset tulevalla tutkimuksella suurista ryhmästä potilaskokeita koskevalla tutkimuksella, jolla on suuria potilaita