ÚLOVEK: Implementace přesné medicíny řízené genomií u metastatického karcinomu prsu (CATCH)

Studijní tok

CATCH má za cíl implementovat personalizované onkologické pracovní postupy do kliniky. Hlavní páteř klinické preciznosti onkologie zahrnuje efektivní diagnostický end-to-end potrubí:

Screening a zařazení pacientů: Pacienti s metastatickým karcinomem prsu (mBC) při počáteční diagnóze lokálně pokročilých/vzdálených metastáz a jakéhokoli dalšího klinického pokroku jsou vyšetřováni z hlediska způsobilosti. Ošetřující lékař musí před zařazením získat písemný informovaný souhlas.

Odběr biomateriálu: Čerstvě zmrazená nádorová tkáň z progresivních prognosticky relevantních metastatických lézí se odebírá během standardních rutinních postupů při vstupu do studie. Při progresi lze nabídnout po sobě jdoucí biopsie. Vzorky krve se odebírají na začátku (V1), aby se zohlednily zárodečné kontroly, a lze je postupně opakovat v 3měsíčních intervalech pro monitorování terapeutické odpovědi.

Zpracování a analýzy vzorků pacientů: Biomateriály jsou zpracovávány centrálně (standardní histologie/IHC a patologický přehled pro obsah nádoru; extrakce analytu, QC podle standardizovaných, jakostně řízených, akreditovaných pracovních postupů (DIN EN ISO/IEC 17025). Extrakce analytu na čerstvě zmrazené tkáni zahrnuje izolaci DNA, RNA a proteinu.

Molekulární profilování (Sekvenování): Genomické profilování (DIN EN ISO/IEC 17025) je centrálně zpracováváno pro zajištění standardizace a zahrnuje celogenomové sekvenování (WGS) na čerstvě zmrazených biopsiích tkáně nebo sekvenování celého exomu (WES) na vzorcích FFPE (v případ neúspěšného odběru biopsie na nedávné lézi kvůli nízkému obsahu nádorových buněk) doplněné sekvenováním RNA.

Klinická bioinformatika/správa dat: Genomické aberace související s nádorem a léčbou spolu se standardními klinickými i histopatologickými parametry jsou analyzovány a uváděny do klinického kontextu, aby bylo možné vymezit biomarkery a alterace, které lze provést, a také řešit základní biologii rezistence na léčbu.

Molecular Tumor Board (MTB): Molekulární data a průkazné profily biomarkerů diskutují lékaři, bioinformatici, molekulární biologové, humánní genetici a patologové v týdenním interdisciplinárním MTB zřízeném v NCT Heidelberg. Biomarkery relevantní pro léčbu a účinné cíle léčiv jsou validovány nezávisle. Terapeutické možnosti jsou v molekulární zprávě upřednostněny.

Implementace terapie: Pacienti budou podrobně informováni ošetřujícím lékařem, aby prodiskutovali potenciální geneticky přizpůsobené možnosti léčby. Hlavním cílem je nabídnout pacientům další intervenční klinické studie a usměrnit přiřazení ke kombinaci biomarkerů/léků řízených genomií.

Sledování / Harmonogram dokumentace: Klinickou dokumentaci vede autorizovaný studijní personál při vstupu do studie v certifikovaném elektronickém formuláři kazuistiky (eCRF) a následně každé 3 měsíce po dobu alespoň 3 let, v jakémkoli intervalu stagingu nebo změně terapie specifické pro rakovinu na vytvořit komplexní registr pacientů. Aby bylo zajištěno komplexní sledování, budou zařazeni pouze pacienti, kteří budou léčeni lokálně na příslušných místech studie. Budou se systematicky shromažďovat molekulární data, která budou řídit projekty translačního průzkumného výzkumu.

Shromažďují se a ukládají se následující údaje (základní a následná hodnocení)

• identifikátor pacienta / demografické údaje (včetně pohlaví, věku v době diagnózy, rodinné anamnézy)
• typ rakoviny / anamnéza / charakteristika diagnóza (včetně data diagnózy)
• klinický výsledek / longitudinální hodnocení onemocnění: relaps a progrese
• genomická a transkriptomická data
• Stav ECOG
• ukázkové informace (např. typ vzorku, histologický typ nádoru, anatomická lokalizace, tkáňové analýzy)
• kvalita života související se zdravím (QoL) / výsledky hlášené pacienty (PRO)

Translační vědecké doprovodné programy: Přebytečný biomateriál nepotřebný pro diagnostický přesný onkologický přístup lze použít pro průzkumný výzkum (např. přístupy ex vivo, tekuté biopsie, imunofenotypizace).

Hodnocení výsledků/výsledků: Molekulární data budou analyzována a interpretována na komplementárních úrovních. Biomarkery a molekulární aberace, jako jsou mutace, amplifikace a aberantní genová exprese, jsou hodnoceny z hlediska jejich nádorové relevance a klinického potenciálu pro zařazení pacientů do specifických klinických studií s přístupy cílené léčby.