FANGST: Implementering av genomikkveiledet presisjonsmedisin ved metastatisk brystkreft (CATCH)

Studer flyt

CATCH har som mål å implementere personaliserte onkologiske arbeidsflyter i klinikken. Den kliniske presisjon onkologi kjerneryggraden omfatter en strømlinjeformet diagnostisk ende-til-ende pipeline:

Pasientscreening og -registrering: Pasienter med metastatisk brystkreft (mBC) ved første diagnose av lokalt avansert-/fjernmetastaser og enhver annen klinisk fremgang screenes for kvalifisering. Behandlende lege må innhente skriftlig informert samtykke før påmelding.

Innsamling av biomateriale: Ferskfrosset tumorvev fra progressive prognostisk-relevante metastatiske lesjoner samles inn under rutinemessige rutineprosedyrer ved studiestart. Påfølgende biopsier kan tilbys ved fremgang. Blodprøver tas ved baseline (V1) for å ta hensyn til kimlinjekontroller og kan gjentas sekvensielt med 3-måneders intervaller for overvåking av terapirespons.

Behandling og analyser av pasientprøver: Biomaterialer behandles sentralt (standard histologi/IHC og patologigjennomgang for tumorinnhold; analyttekstraksjon, QC i henhold til standardiserte, kvalitetskontrollerte, akkrediterte arbeidsflyter (DIN EN ISO/IEC 17025). Analyttekstraksjon på ferskfrosset vev omfatter DNA, RNA og proteinisolering.

Molekylær profilering (sekvensering): Genomisk profilering (DIN EN ISO/IEC 17025) behandles sentralt for å sikre standardisering og omfatter helgenomsekvensering (WGS) på ferskfryste vevsbiopsier eller heleksomsekvensering (WES) på FFPE-prøver (i tilfelle av mislykket biopsiprøvetaking på nylig lesjon på grunn av lavt tumorcelleinnhold) supplert med RNA-sekvensering.

Klinisk bioinformatikk / Datakurering: Tumor- og behandlingsrelevante genomiske avvik sammen med standard kliniske så vel som histopatologiske parametere analyseres og settes inn i den kliniske konteksten for å avgrense biomarkører og handlingsbare endringer, samt for å takle den underliggende biologien til behandlingsresistens.

Molecular Tumor Board (MTB): Molekylær data og avgjørende biomarkørprofiler diskuteres av klinikere, bioinformatikere, molekylærbiologer, humangenetikere og patologer i en ukentlig tverrfaglig MTB etablert ved NCT Heidelberg. Behandlingsrelevante biomarkører og handlingsbare medikamentmål valideres uavhengig. Terapeutiske alternativer er prioritert i en molekylær rapport.

Implementering av terapi: Pasientene vil bli informert i detalj av den behandlende legen for å diskutere potensielle genetisk tilpassede behandlingsalternativer. Hovedmålet er å tilby pasienter ytterligere intervensjonelle kliniske studier og drive oppdrag mot genomikk-veiledet matchet biomarkør / medikamentkombinasjoner.

Oppfølging / dokumentasjonsplan: Klinisk dokumentasjon utføres av autorisert studieperson ved studiestart i et sertifisert elektronisk case report form (eCRF) og deretter hver 3. måned i minst 3 år, ved ethvert iscenesettelsesintervall eller kreftspesifikk terapiendring til generere et omfattende pasientregister. For å sikre omfattende oppfølging vil det kun bli registrert pasienter som vil bli behandlet lokalt ved de involverte prøvestedene. Molekylære data vil systematisk samles inn for å drive translasjonelle utforskende forskningsprosjekter.

Følgende data samles inn og lagres (grunnlinje- og oppfølgingsvurderinger)

• pasientidentifikator/demografi (inkludert kjønn, alder ved diagnose, familiehistorie)
• krefttype / medisinsk historie / karakteristikk diagnose (inkludert dato for diagnose)
• klinisk utfall / longitudinelle sykdomsvurderinger: tilbakefall og progresjon
• genomiske og transkriptomiske data
• ECOG-status
• eksempelinformasjon (f.eks. prøvetype, histologisk tumortype, anatomisk plassering, vevsanalyser)
• helserelatert livskvalitet (QoL) / pasientrapporterte resultater (PRO)

Translasjonsvitenskapelige ledsagerprogrammer: Overflødig biomateriale som ikke er nødvendig for den diagnostiske presisjononkologiske tilnærmingen kan brukes til utforskende forskning (f.eks. ex vivo-tilnærminger, flytende biopsier, immunfenotyping).

Resultater / Resultatevaluering: Molekylære data vil bli analysert og tolket på komplementære nivåer. Biomarkører og molekylære aberrasjoner som mutasjoner, amplifikasjoner og avvikende genuttrykk blir evaluert for deres tumorrelevans og kliniske potensiale for å tildele pasienter til spesifikke kliniske studier med målrettede behandlingstilnærminger.