Identifikation af herpes simplex virus (HSV) udskillelse i kvindelige kønsorganer hos gravide og ikke-gravide kvinder ved GeneXpert PCR, rutinemæssig PCR og kultur

GeneXpert HSV PCR-testen vil blive valideret mod HSV virale kulturer og rutinemæssig kvantitativ PCR. Validering vil forekomme i to populationer: 1) ikke-gravide kvinder i STI-klinikker med klinisk tydelige HSV-læsioner (Gruppe 1, n=300), og 2) gravide kvinder i aktiv fødsel uden synlige tegn på HSV-infektion (Gruppe 2, n= 12.500). Al testning af prøver på GeneXpert-platformen, rutinemæssig kvantitativ PCR og viral kultur vil blive udført på UAB Central Laboratory. Kvinder i hver gruppe vil få prøver fra genitale læsioner (Gruppe 1) eller vaginale podninger (Gruppe 2). Prøver fra alle kvinder i gruppe 1 vil blive evalueret ved hjælp af HSV-kultur, rutinemæssig HSV PCR og GeneXpert HSV PCR. Cirka halvdelen af ​​kvinderne i gruppe 2 vil blive testet ved rutinemæssig HSV PCR og GeneXpert HSV PCR; prøver fra resten af ​​kvinderne i gruppe 2 vil blive opbevaret til mulig testning i fremtiden ved rutinemæssig HSV PCR og GeneXpert HSV PCR. På denne måde vil vi maksimere de data, hvorfra vi kan sammenligne GeneXpert PCR-resultater med rutine-PCR, samtidig med at vi opretholder fleksibiliteten for at sikre, at et tilstrækkeligt antal prøver er positive for HSV-DNA ved rutine-PCR.

Podninger fra gravide kvinder i fødsel vil blive placeret i virale transportmedier, frosset ved -20°C og batch-forsendet til UAB Central Laboratory til analyse på GeneXpert-instrumentet og ved rutinemæssig HSV kvantitativ PCR. Podninger fra ikke-gravide kvinder i STI-klinikker vil blive placeret i virale transportmedier, nedkølet ved 4°C og sendt til UAB Central Laboratory til realtidsanalyse på GeneXpert-instrumentet og ved HSV-kultur og rutinemæssig kvantitativ HSV-PCR. Prøver fra de første 300 kvinder, der er tilmeldt gruppe 2, vil blive kørt som individuelle rutine-PCR'er og i batcher af 5 prøver pr. PCR-kørsel. På denne måde vil vi validere, at detektionsniveauet fra batching af prøver til rutine-PCR er acceptabelt. Når denne validering finder sted, vil prøver fra ca. halvdelen af ​​de resterende gruppe 2-kvinder blive batchet til rutinemæssig PCR-analyse i realtid. Hvis en batchkørsel på 5 prøver er negativ, vil der ikke blive udført yderligere test. Hvis en batchkørsel på 5 prøver er positiv, vil alle prøverne blive adskilt til genkørsel som individuelle PCR'er. Alle prøver vurderet ved rutine-PCR vil også blive evalueret af GeneXpert PCR; på denne måde vil vi have individuelle rutinemæssige PCR-resultater til sammenligning med GeneXpert PCR-resultater.

En blodprøve vil blive taget fra hver ikke-gravide (Gruppe 1) og gravid (Gruppe 2) kvinde på tilmeldingstidspunktet, og hvis hun er fast besluttet på at udskille HSV ved rutine-PCR, GeneXpert PCR eller dyrkning, skal hun typespecifik serologisk testning vil blive udført. Korrelation af viral typebestemmelse fra den virologiske prøvetagning med HSV-1 og HSV-2 serostatus vil tillade kategorisering af infektion (første-episode primær, første-episode ikke-primær eller tilbagevendende infektion).

De kvinder i gruppe 1, som har en positiv HSV-kultur, vil blive kontaktet direkte, når resultatet er kendt. Kvinder i gruppe 2 med et positivt HSV PCR-resultat vil ikke blive kontaktet, fordi rutinemæssig HSV PCR og GeneXpert PCR ikke er FDA-godkendte test i denne population; således vil vi ikke kende testens ydeevnekarakteristika (f.eks. sensitivitet, specificitet osv.) før afslutningen af ​​forsøget. Alle gravide kvinder i gruppe 2 vil modtage skriftligt materiale på tidspunktet for tilmeldingen, der informerer dem om tegn og symptomer på neonatal HSV-sygdom. Alle postpartum kvinder vil blive kontaktet telefonisk 60-90 dage efter fødslen, og der vil blive foretaget en forespørgsel for at afgøre, om deres babyer udviklede neonatal HSV-sygdom.

Data om forekomsten af ​​neonatal HSV-sygdom blandt babyer født til kvinder i gruppe 2 vil blive sammenlignet med forekomstdataene fra Brown et al.1 I deres undersøgelse af næsten 60.000 kvinder udført over en 20-årig periode har denne gruppe forskere rapporteret en incidensrate for neonatal HSV-sygdom på 1 ud af 3.200 levendefødte.