Vertaileva tutkimus suurapinoiden hoitajien mikrobiomista (SHAPES-CAP)

SHAPES-Captivity -tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa ihmisten ja vankeudessa pidettyjen ihmisapinoiden ja suoliston mikrobiomin metagenomiset komponentit, jotka elävät lähellä ja suorassa, päivittäisessä kosketuksessa. SHAPES-Captivity on jatkoa SHAPES-tutkimukselle (rahoittaja ANR vuonna 2014), joka on parhaillaan käynnissä Keski-Afrikassa (Kongon demokraattinen tasavalta, Kamerun, Gabon). Kamerunissa tutkijat ovat keränneet ulostenäytteitä gorilloista, simpansseista ja ihmisistä käyttämällä samaa metsätilaa analysoidakseen heidän suoliston mikrobiomiensa päällekkäisyyttä. Tämän analyysin tuloksia tulkitaan tällä alueella asuvien ihmisten keskuudessa kerätyn antropologisen ja maantieteellisen näytön valossa. SHAPES-Captivity antaa tutkijoille mahdollisuuden käyttää samaa lähestymistapaa, mutta tällä kertaa apinavankeuden olosuhteissa. Näin tutkijat saavat tietoa suoliston mikrobiomin päällekkäisyydestä vankeudessa pidettyjen suurapinoiden ja valvotussa ympäristössä ja päivittäisessä, suorassa kontaktissa työskentelevien ihmisten hoitajien välillä. SHAPES-Captivity -tutkimus antaa positiivisen kontrollin, jota verrataan lopulta SHAPES-tutkimuksen tuloksiin. Vaikka useat tutkimukset ovat tutkineet ihmisen ja isoapinan suoliston mikrobiomin päällekkäisyyttä (Moeller et al. 2012; Moeller et al. 2016), mikään näistä tutkimuksista ei ole tutkinut ihmisiä, jotka asuvat lähellä suurapinoita joko luonnollisessa tai vankeudessa. . Tutkijat määrittävät ihmisten ja suurapinoiden välisten enterotyyppien (bakteeri- ja virusperäisten) fylogeneettisen monimuotoisuuden ja yhdistävät nämä tulokset osallistujien havaintoihinsa hoitajien toiminnasta (ja kontakteista) näihin suurapinoihin.