Sammenlignende studie av den store apeoppsynsmannens mikrobiom (SHAPES-CAP)

SHAPES-Captivity-studien søker å identifisere metagenomiske komponenter i tarmmikrobiomet som deles av mennesker og menneskeaper i fangenskap som lever i nærheten og i direkte, daglig kontakt. SHAPES-Captivity er en utvidelse av SHAPES-studien (finansiert av ANR i 2014), som for tiden pågår i Sentral-Afrika (Den demokratiske republikken Kongo, Kamerun, Gabon). I Kamerun har etterforskerne samlet inn avføringsprøver fra gorillaer, sjimpanser og mennesker ved å bruke samme skogplass for å utføre en analyse av overlappingen av deres tarmmikrobiom. Resultatene av denne analysen vil bli tolket i lys av antropologiske og geografiske bevis samlet inn blant mennesker som bor i denne regionen. SHAPES-Captivity vil gjøre det mulig for etterforskerne å bruke den samme tilnærmingen, men denne gangen, under forhold med store aper fangenskap. Etterforskerne vil dermed innhente data om intestinal mikrobiom overlapping mellom menneskeaper i fangenskap og menneskelige omsorgspersoner som arbeider i et kontrollert miljø og i daglig, direkte kontakt. SHAPES-Captivity-studien vil gi en positiv kontroll, som til slutt vil bli sammenlignet med resultater fra SHAPES-studien. Selv om flere studier har undersøkt overlappingen mellom menneske-apes intestinale mikrobiom (Moeller et al. 2012; Moeller et al. 2016), har ingen av disse studiene undersøkt mennesker som lever i umiddelbar nærhet til menneskeaper, verken i naturlige eller fangede omgivelser . Etterforskerne vil bestemme det fylogenetiske mangfoldet av enterotyper (bakterielle og virale) som deles mellom mennesker og menneskeaper, og vil koble disse resultatene med deres deltaker-observasjoner av vaktmesternes aktiviteter (og kontakter) med disse menneskeapene.