Sammenlignende undersøgelse af den store abeplejermikrobiom (SHAPES-CAP)

SHAPES-Captivity-undersøgelsen søger at identificere metagenomiske komponenter i tarmmikrobiomet, som deles af mennesker og menneskeaber i fangenskab, der lever i nærheden og i direkte, daglig kontakt. SHAPES-fangenskabet er en forlængelse af SHAPES-undersøgelsen (finansieret af ANR i 2014), der i øjeblikket er i gang i det centrale Afrika (Den Demokratiske Republik Congo, Cameroun, Gabon). I Cameroun har efterforskerne indsamlet afføringsprøver fra gorillaer, chimpanser og mennesker ved at bruge det samme skovrum for at udføre en analyse af overlapningen af ​​deres tarmmikrobiom. Resultaterne af denne analyse vil blive fortolket i lyset af antropologiske og geografiske beviser indsamlet blandt mennesker, der bor i denne region. SHAPES-Captivity vil gøre det muligt for efterforskerne at bruge den samme tilgang, men denne gang under forhold med store abefangenskaber. Efterforskerne vil således indhente data vedrørende intestinal mikrobiom overlap mellem menneskeaber i fangenskab og menneskelige viceværter, der arbejder i et kontrolleret miljø og i daglig, direkte kontakt. SHAPES-Captivity undersøgelsen vil give en positiv kontrol, som til sidst vil blive sammenlignet med resultater fra SHAPES undersøgelsen. Selvom adskillige undersøgelser har undersøgt overlapningen mellem menneske-store abers tarmmikrobiom (Moeller et al. 2012; Moeller et al. 2016), har ingen af ​​disse undersøgelser undersøgt mennesker, der lever i umiddelbar nærhed af menneskeaber, hverken i naturlige eller fangede omgivelser . Efterforskerne vil bestemme den fylogenetiske mangfoldighed af enterotyper (bakteriel og viral) delt mellem mennesker og menneskeaber, og vil forbinde disse resultater med deres deltager-observationer af viceværtens aktiviteter (og kontakter) med disse menneskeaber.