Koko eksomin ja koko genomin sekvensointi perinnöllisten ja synnynnäisten silmäsairauksien genotyypitystä varten

Tavoite: Tämän tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa perinnöllisten silmäsairauksien geneettisiä syitä koko eksomin tai koko genomin sekvensoinnilla (viitataan asiakirjan loppuosassa nimellä eksomin sekvensointi ja genomin sekvensointi). Tämä sisältää mutaatioiden tunnistamisen tunnetuissa geeneissä tai uusissa geeneissä tunnistetuissa sairauksissa sekä uusien geenien mutaatioiden tunnistaminen aiemmin luonnehtimattomien geneettisten tilojen osalta, joihin liittyy silmä.

Tutkimuspopulaatio: Suunnittelemme rekrytoivamme 1 685 osallistujaa, mukaan lukien sekä tutkittavana olevat silmäsairautta omaavat osallistujat että terveet perheenjäsenet. Ihannetapauksessa perheenjäsenet, jotka eivät vaikuta asiaan, ovat asianomaisen osallistujan vanhempia.

Suunnittelu: Osallistujat ohjaavat itsensä tai ulkopuolinen kliinikko. Ne arvioidaan mieluiten NIH:ssa, mutta mahdollisuus osallistua myös muualla tarjotaan. Paikalla arvioitavat osallistujat rekrytoidaan muiden olemassa olevien NIH-protokollien, kuten NEI-seulontaprotokollan (08-EI-0102), NEI Ocular Natural History -protokollan (16-EI-0134), perinnöllisen silmätaudin geneettisen protokollan (Genetics of Herited Eye Disease) avulla. 15-EI-0128), ja Microphthalmia, Anophthalmia ja Uveal Coloboma (MAC) -protokollan patogeneesi ja genetiikka (13-EI-0049).

Ulkopuoliset osallistujat seulotaan puhelimitse tai suojatulla videoneuvottelulla, ja niistä pyydetään tallenteita arvioitaessa osallistujia, joita asia koskee. Sekä sairastuneille että terveydelle kelvollisille osallistujille käydään geneettistä neuvontaa ja he tarjoavat verinäyte- ja/tai sylkinäytteen eksomin tai genomin sekvensointia varten. Biologiset suhteet varmistetaan ennen eksomin tai genomin sekvensointia. Sekvenssitiedoista analysoidaan ensisijaiset variantit ja toissijaiset löydökset, elleivät osallistujat päätä kieltäytyä toissijaisesta analyysistä ja raportoinnista. Kaikki kliinisesti merkityksellisiksi katsotut sekvenssivariantit validoidaan CLIA-sertifioidussa laboratoriossa ja tulokset palautetaan osallistujalle henkilökohtaisesti, suojatussa videoneuvottelussa tai puhelimitse.

Tulostoimenpiteet: Tämä on etiologinen tutkimus, joka tuottaa molekyylitietoa aiemmin tunnistetuista tiloista, joille osallistujilla ei ollut molekyylidiagnoosia, sekä molekyylitietoa aiemmin määrittelemättömistä silmätiloista.