Lasten poikkeavuuksien ja syövän geneettinen päällekkäisyys lasten onkologiaryhmässä: COG GOBACK -tutkimus

Yksi vahvimmista lasten ja nuorten syövän riskitekijöistä on synnynnäinen poikkeavuus. Itse asiassa rekisterin linkitystutkimusten tiedot viittaavat siihen, että 10–15 % lasten syöpäriskistä voi johtua synnynnäisestä poikkeavuudesta. Koska arviolta 10 miljoonaa lasta maailmassa syntyy vuosittain synnynnäisillä poikkeavuuksilla, kansanterveydelliset vaikutukset sen selvittämisellä, miksi joillekin näistä lapsista kehittyy syöpää, ovat näin ollen merkittäviä. Vaikka nämä tutkimukset ovat olleet informatiivisia, rekisteritiedot eivät yksinään tarjoa mahdollisuutta molekyyli- tai sekvensointitutkimuksiin, joilla tunnistetaan poikkeavuuksien ja syöpäalttiuden samanaikaisen esiintymisen taustalla oleva spesifinen geneettinen perusta. Siksi tutkijat kehittivät poikkeavuuksien ja lasten syövän geneettisen päällekkäisyyden (GOBACK) -tutkimuksen ensimmäisen vaiheen puuttuakseen näihin rajoituksiin. Käyttäen neljän osavaltion synnynnäisiä epämuodostumia ja syöpärekistereitä saatuja tietoja, tutkijat tunnistivat lukuisia uusia spesifisiä poikkeavuus-syöpäyhdistelmiä. GOBACK-tutkimuksessa tutkijat havaitsivat kasvaneen syöpäriskin lapsilla, joilla oli kromosomipoikkeavuuksia ja ei-kromosomaalisia synnynnäisiä epämuodostumia. Lisäksi lapset, joilla oli synnynnäisiä poikkeavuuksia, kehittivät erilaisia ​​syöpiä, joten tutkijat ehdottavat, että arvioitaisiin useita syöpiä synnynnäisiä epämuodostumia omaavien lasten keskuudessa. Yhdistämällä rekisteritiedot neljästä osavaltiosta GOBACK-tutkimuksessa tutkijat havaitsivat, että lapsilla, joilla on ei-kromosomaalisia synnynnäisiä epämuodostumia, on merkittävästi kohonnut riski saada useita lapsuuden syöpiä. Erityisesti monet näistä synnynnäisistä poikkeavuuksista eivät ole tyypillisiä tunnetuille syöpäalttiusoireyhtymille. Siksi alustavat tutkimuksemme luovat puitteet tälle sovellukselle. Tämän tutkimuksen tavoitteena on (1) tutkia niiden lasten genomeja, joilla on samanaikaisesti esiintyviä ei-kromosomaalisia synnynnäisiä poikkeavuuksia ja syöpä, jotka osallistuivat Project:EveryChild -ohjelmaan, jotta voidaan tunnistaa näihin yhdistettyihin fenotyyppeihin liittyvät geneettiset piirteet ja (2) varmistaa synnynnäiset poikkeavuudet ja määrittää fenotyyppispektri syöpään sairastuneista lapsista, jotka on ilmoittautunut Project:EveryChild -ohjelmaan, joilla on itse ilmoittamia synnynnäisiä poikkeavuuksia ("syvä fenotyyppi"). Tässä tutkimuksessa tutkijat käyttävät Project:EveryChild -ohjelmaa tunnistaakseen, ottaakseen yhteyttä ja rekisteröidäkseen tapaus-vanhempien triot lapsille, joilla on samanaikaisesti esiintyviä ei-kromosomaalisia synnynnäisiä poikkeavuuksia ja syöpiä. Jokaisesta rekisteröidystä perheestä tutkijat keräävät DNA:n sairastuneesta tapauksesta ja yhdestä tai molemmista biologisista vanhemmista, jolloin jokainen tapaus-vanhempi kolmikko muodostaa. Tutkijat ottavat mukaan sisaruksia, jos niitä on saatavilla. Tutkijat myös karakterisoivat tapaus-vanhempi-kolmioita demografisten ja kliinisten ominaisuuksien perusteella käyttämällä itseläytettyjen kyselylomakkeiden ja sairauskertomusten avulla kerättyä tietoa. Viime kädessä tämän tutkimuksen havainnot voivat johtaa 1) mahdollisten geneettisten mekanismien määrittämiseen, jotka ovat näiden samanaikaisesti esiintyvien tilojen taustalla; 2) syöpäriskien hallintastrategioiden parantaminen synnynnäisiä epämuodostumia omaavien lasten keskuudessa; ja 3) synnynnäisten epämuodostumien roolin tunnistaminen syöpädiagnoosin saaneiden lasten tuloksissa ja selviytymisessä.