Facteurs génétiques et déterminisme immunologique des conséquences persistantes du Chikungunya (CHIKGENE)

L'infection par le virus Chikungunya (CHIKV) est devenue une menace pour la santé publique dans le monde entier. La Réunion, du fait de l'épidémie de 2005-2006, a acquis une expertise unique et reste à la pointe de la recherche mondiale sur cette maladie. L'idée d'un déterminisme génétique de l'expression clinique des maladies infectieuses a été étayée par de nombreux arguments épidémiologiques au cours des cinquante dernières années. L'identification de variants génétiques, associés à une maladie, permet souvent une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires impliqués avec des bénéfices significatifs conséquents comme le développement de biomarqueurs spécifiques pour de nouvelles approches préventives (vaccination) et/ou thérapeutiques (drug design). En l'absence d'hypothèses bien documentées sur les gènes potentiellement impliqués dans la survenue ou l'évolution d'une maladie, les études d'association pangénomique (GWAS), génome entier, des polymorphismes nucléotidiques (SNP) et le principe de déséquilibre de liaison, sous les l'hypothèse admise que l'expression d'une maladie commune repose sur un petit nombre d'allèles communément retrouvés dans la population (fréquence d'allèle mineur supérieure à 1-5%), sont devenues une méthode de choix, sans hypothèse, pour préciser la partie de l'héritabilité d'une maladie complexe et d'identifier ses déterminants génétiques. Plusieurs arguments épidémiologiques soutiennent une part importante du déterminisme génétique dans l'explication du schéma évolutif du Chikungunya, dont la proportion de formes chroniques peut atteindre 40 à 60 % dans les études en population menées dans les deux années suivant une épidémie :

• Les facteurs de risque associés aux formes chroniques sont peu nombreux et apparaissent peu clairs (âge, comorbidités avec plusieurs éléments du syndrome métabolique) ou incohérents (charge immunitaire) dans les études de population ;
• L'incidence des formes sévères ou atypiques est rare de l'ordre de 1 % des infections ;
• Contrairement à la phase aiguë (J1-J21) pour laquelle il semble y avoir un rôle de l'intensité de la charge virale et une signature immunitaire pro-inflammatoire consensuelle selon une méta-analyse récente] ; Le rôle de l'intensité de la charge virale dans la pathogenèse des arthralgies chroniques (> J90) et leur signature immunitaire restent à déterminer, cette dernière étant plutôt aspécifique, selon des études menées à La Réunion, en Italie ou à Singapour.

Ces éléments justifient l'intérêt d'une GWAS dans le Chikungunya pour identifier de nouvelles pistes et hypothèses mécanistes susceptibles d'expliquer les arthralgies chroniques caractéristiques de la maladie.