인간과 동물의 원헬스 접근법을 사용한 라오스의 COVID-19 역학 조사 (LACOVISS)

1. 소개

   이 프로젝트는 주로 해결되지 않은 두 가지 주요 질문을 기반으로 합니다. 첫 번째는 발병의 기원과 SARS-CoV-2가 인간에게 전파된 사건입니다. 두 번째는 중국 남서부와 유사한 생물지리학적, 사회생태학적 특성을 공유하고 있음에도 불구하고 라오스의 놀라운 역학 상황입니다. 야생 동물군의 다양성(특히 중국 남부와 동남아시아) , 박쥐 다양성이 100종 이상으로 최고조에 달함), 특히 라오스 PDR에서 코로나바이러스의 광범위한 순환과 관련하여 진화 및 동물원성 잠재력은 라오스에서 (과거 또는 미래) 출현이 예상될 수 있음을 나타냅니다. 또한 라오스와 중국 간의 대규모 인구 이동을 감안할 때 중국에서 라오스로 COVID-19의 상당한 확산이 예상되었습니다. 이 두 가지 주요 질문에 답하기 위해 조사관은 이 프로젝트에서 다룰 다음 작업 가설을 공식화합니다.

   가정 1: COVID-19는 감염된 개인의 국가 도착을 통해 가까운 장래에 라오스 인구에게 대규모로 퍼질 수 있습니다.

   가정 2: SARS-CoV-2는 중국에서 COVID-19 발병이 나타나기 전에 이미 라오스에서 유포되었습니다.

   가정 3: SARS-CoV-2는 야생 동물에서 뛰어내려 미래에 라오스 인구로 나타날 수 있습니다. 가정 4: 일부 유전적으로 밀접하게 관련된 바이러스(SARS-CoV-2 유사 바이러스)는 이미 라오스에서 퍼졌습니다.

2. 목표

   이 프로젝트의 일반적인 목적은 ONE-HEALTH 접근법에 따라 라오스에서 바이러스의 순환을 조사하여 COVID-19의 자연사를 밝히는 것입니다. 중국.

   특히 조사관들은 생물지리적, 사회생태학적 특징을 공유하고 중국 남서부와 국경을 넘고 있음에도 불구하고 현재까지 중국에서 관찰된 COVID-19 양성 환자 수가 상대적으로 적은 원인과 발병 진행 상황을 조사할 예정입니다. .

   이 일반 표제에서 2차 목표는 다음과 같습니다.

   인간의 경우:

   2019년 12월 중국 우한에서 첫 양성 사례가 나타나기 전에 코호트 내 COVID-19 순환을 확인하기 위해 프로젝트 시작부터 1년 동안 COVID-19 진행 상황을 확인하기 위해 SARS-CoV- 2 무증상 감염 과거 SARS-CoV-2 순환 평가

   동물에서:

   애완동물 및 가축에 대한 SARS-CoV-2 전파 조사

3. 방법론

   인간의 경우:

   이 프로젝트는 5,400명의 연구 참가자를 포함하여 1,092가구의 지역사회 기반 코호트 내에서 수행되며, 인플루엔자 유사 질병 조사 및 원인 물질 탐지를 위해 2015년 3월부터 2019년 2월 사이에 후속 조치를 취할 것입니다(LACORIS 프로젝트, 비엔티안 코호트 중 호흡기 감염 질환). Capital, Lao PDR), Lao PDR의 Vientiane 수도권에 위치(참조 1 및 내부 보고서).

   • 후향적 접근법: 2019년 12월 중국 우한에서 첫 양성 사례가 나타나기 전 코호트 내 COVID-19 순환을 확인하기 위해 5400 연구를 포함하여 1092가구의 코호트에서 수집한 샘플에서 후향적 SARS-CoV-2 RNA 검출을 수행했습니다. 참가자, 2015년 3월부터 2019년 2월 사이에 후속 조사(LACORIS 프로젝트)(1 및 내부 보고서).
   • 전향적 접근법: 인플루엔자 유사 질병을 나타내는 개인의 SARS-CoV-2 RNA 검출을 통해 프로젝트 시작부터 1년 동안 COVID-19 진행 상황을 확인합니다.
   • 이를 위해 프로젝트의 예상 단계에서 감지된 COVID-19 양성 사례의 접촉에서 SARS-CoV-2 RNA 검출을 통해 가족 내 및 지역사회 내 전파율과 상황을 평가합니다.
   • 코호트 연구의 무작위 그룹에서 타액 면봉에서 특정 항체를 스크리닝하여 과거 SARS-CoV-2 순환을 평가합니다.

   동물에서:

   - 프로젝트의 예상 단계에서 양성 사례가 있거나 거의 양성인 동물의 RNA 검출을 통해 애완 동물 및 가축에 대한 SARS-CoV-2 전파를 조사합니다.

4. 연구 장소 및 인구

   이 연구는 비엔티안 대도시 지역의 행정 경계 내에 있는 25개 마을에 거주하는 5400명의 연구 참가자를 포함하여 1092가구를 대상으로 합니다. 가구는 같은 토지(하나 이상의 주택) 또는 같은 건물(아파트)에 거주하고 식사를 공유하는 개인 그룹으로 정의되었습니다. 모든 연구 공동 조사자는 연구의 특정 측면.

5. 연구 흐름도

5.1 ILI 증상이 있는 참가자의 흐름도

SARS-CoV-2 양성 개인과 함께 6개월 이상 거주하는 모든 가족 구성원은 SARS-CoV-2 탐지를 위한 비침습적 검사(비강, 인후, 면봉, 타액) 및 설문지를 받게 됩니다.

연구 참여

정보: 모든 참가자는 연구에 참여하기 위한 서면 정보 양식을 받게 됩니다. 이 양식은 연구의 범위와 의도, 연구 조사자의 의무 및 코호트 구성원의 기대에 대한 정보를 제공합니다.

동의 수집: 연구가 시작되기 전에, 프로젝트의 세부 사항을 설명하기 위해 가정의 조사 감시 팀과 약속을 잡을 것입니다. 이러한 세부 사항에는 환자 및 가족 구성원을 위한 인플루엔자 유사 질병의 경우 호흡기 면봉 샘플 채취가 포함됩니다. 팀은 정보 양식을 제출하고 사전에 세 사람(면담자, 부모 또는 보호자, 증인/가족 구성원)이 서명한 각 가족 구성원으로부터 서면 동의서를 수집합니다.

코호트 참여:

프로젝트 연구는 1년에 걸쳐 연장되며 윤리 승인을 받는 즉시 시작됩니다. CILM에 이미 설정된 데이터베이스에 따라 가구는 가구 등록부에서 선택되고 방문 샘플링을 통해 코호트에 등록됩니다. 가구는 같은 대지(하나 이상의 주택) 또는 같은 건물(아파트)에 거주하며 식사를 함께하는 개인 그룹으로 정의됩니다. 1년 동안 CILM 직원이 각 가정에 매주 전화 통화(N=500)를 통해 코호트에서 인플루엔자 유사 질병(ILI)에 대한 활성 사례 찾기를 수행할 것입니다. 병원체 식별 가능성을 높이기 위해 연구 참여자가 증상 발생을 자가 보고하도록 권장하여 조기에 검체를 수집할 수 있습니다. 사례가 ILI-WHO 기준을 충족하는 즉시 현장 교육을 받은 의료진(조사 감시팀)이 당일 무료 방문을 구성하여 질병 적격 기준을 인터뷰하고 확인하여 질병을 완료합니다. 증상에 대한 세부 정보가 수집되는 조사 설문지.

진단 결과 및 ILI 후속 조치:

COVID 19 분석 결과(양성 또는 음성)는 NCLE(National Center for Laboratory and Epidemiology)로 전송됩니다.

결과가 COVID19 양성이면 NCLE는 "COVID-19 팬데믹 예방, 통제 및 대응을 위한 전국 태스크포스 위원회"에 이를 보낼 것입니다. COVID-19 양성 환자는 이 국가 위원회에서 관리하고 공식적인 절차에 따라 후속 조치를 취할 것입니다.

위원회 권고에 따르면 무증상 감염자를 찾기 위해 COVID-19 환자와 함께 살고 있는 모든 가족 구성원을 샘플링할 것입니다. 다른 모든 경우(다른 호흡기 바이러스 검출 또는 음성 결과) 결과는 현장에서 서면으로 참가자(성인 또는 12세에서 18세 사이의 어린이) 또는 부모 또는 보호자( 12세 미만의 어린이 또는 정신 장애가 있는 성인) 참가자는 치료를 위해 의사 또는 지역 의료 기관에 소개됩니다. 비엔티안에는 4개의 종합병원이 있고 우리 연구에 포함된 25개 마을 각각에 여러 지역 의료 시설이 있습니다. 환자가 ILI에 걸리면 우리 팀의 의사는 환자에게 취해야 할 치료, 가족의 다른 구성원의 감염을 피하기 위해 취해야 할 예방 조치에 대해 조언하고 그를 가장 가까운 의료 기관으로 안내할 것입니다. 예외적인 경우를 제외하고는 프로젝트에서 물류(운송) 또는 의료 지원을 권장하지 않습니다.

입원 또는 사망을 포함한 전반적인 건강 상태를 결정하기 위해 환자 또는 그 가족은 60일 후에 참석할 것입니다.

5.2 연구 종료

연구가 끝나면 최종 보고서가 각 가구에 전달되고 면접관이 결과를 설명합니다.

매주 가장은 전화로 가족 중 한 명이 질병의 징후를 보였는지 묻습니다. 3주 연속 참가자의 소식이 없을 경우 조사원이 현장에 출동해 보다 정밀한 조사를 진행한다.

5.3 설문지

전반적으로 이 연구에는 두 가지 종류의 설문지가 포함됩니다.

사회인구학적 세부 사항을 포함한 가구 등록 설문지. 매주 가정 방문, 질병 조사 및 후속 조사를 목적으로 참여 마을의 데이터베이스를 구축하기 위해 등록 시 인구 조사 질문을 합니다. 이 설문지는 등록 시 정보 양식이 전달되고 정보에 입각한 동의서 서명을 받을 때 각 세대의 면접관이 작성합니다.

ILI 질병의 세부 사항을 포함하는 질병 조사 설문지. 묻는 질문은 질병을 보고하는 사람에 대한 정보를 제공하며 기본 임상 관찰 및 질병의 원인을 이해하는 데 관련된 기타 정보를 포함합니다. 이 설문지는 샘플 수집 시 면접관이 작성합니다.

표준 프로토콜을 사용하여 수집할 표본은 다음과 같습니다.

• 상부 호흡기 면봉(타액, 인후 및 비강 면봉): "COVID-19 전염병 예방, 통제 및 대응을 위한 국가 태스크포스 위원회"의 권장 사항에 따라 운송 매체에서 샘플을 수집합니다. 각 샘플은 훈련된 현장 직원이 플라스틱 샤프트가 있는 멸균 나일론 면봉을 사용하여 수집하고 UTM(Universal Transport Media)이 들어 있는 멸균 냉동 바이알에 삽입됩니다.
• 샘플은 테스트를 위해 냉장 냉각기에 넣어 CILM으로 운반됩니다.
• 환자 식별 번호(아래 참조)는 관계형 데이터베이스와 설문지 및 수집된 모든 표본에 미리 인쇄된 라벨로 연결됩니다.
• SARS-CoV2(RdRp, N 및 E 유전자를 표적으로 함) 및 RdRp를 표적으로 하는 Pan-coronavirus에 대한 특정 qPCR은 후향적 및 예상 비강 면봉, 인후 면봉 및 객담 표본에서 추출한 RNA에서 수행됩니다. 분석은 CILM(라오스 비엔티안)에서 수행됩니다. 각 양성 샘플은 시퀀싱되고 참조 시퀀스와 비교됩니다.
• 특정 IgG 테스트는 타액 면봉에서 luminex 및 ELISA 기술로 수행됩니다.
• 테스트 후 샘플은 추가 분석이 요청될 때까지 최소 15년 동안 CILM에서 -80°C로 보관됩니다. 샘플은 Lao PDR 당국과 CILM 직원 관리자의 요청에 따라 최소 15년 후에 폐기될 수 있습니다.
• 연구 조정 조사관(Phimpha Paboriboune 및 Eric Leroy)의 요청과 과학 위원회의 동의에 따라 양성 샘플의 유전 물질이 MIVEGEC UMR IRD 224-CNRS 5290-Université de Montpellier - IRD(911, avenue Agropolis)로 전송됩니다. , 34394 Montpellier France) CILM 또는 전체 게놈 시퀀싱에서 수행할 수 없는 추가 분석을 위해.