Clasificación molecular en pacientes mexicanas con cáncer de endometrio y su impacto en el pronóstico

Los investigadores llevarán a cabo un estudio piloto en pacientes con CE de tipo endometrioide tratados entre 2015-2019. Ya se recolectan muestras de pacientes mayores de 18 años admitidos en la cohorte con diagnóstico de CE de tipo endometrioide y serán evaluadas para la secuenciación del exoma (N = 32) y la detección de mutaciones POLE. El ADN se extraerá utilizando el kit "DNA/RNA AllPrep" (QIAGEN). La verificación de una extracción de ADN adecuada se realizará mediante la cuantificación mediante TapeStation (Agilent). La secuenciación del exoma (N = 32 muestras tumorales y 32 muestras somáticas [leucocitos] del mismo paciente) se llevará a cabo utilizando el exoma de captura rápida Nextera de Illumina en Azenta Life Science (Nueva Jersey, EE. UU.) siguiendo protocolos preestablecidos y con una profundidad de 100X. El alineamiento y detección de variantes se realizará con GATX-Mutect Suite (Broad Institute, USA) y la anotación del filtrado de variantes con ANNOVAR. La identificación de los puntos críticos se realizará según el estudio de Chen. La inmunohistoquímica (IHC) para la inestabilidad de microsatélites y el mutante sobreexpresado TP53 (N = 94) se realizará utilizando protocolos IHC establecidos e incluirá MSH2, MLH1, PMS1, PMS2, MSH6, MSH3 y TP53.