Selfie-tutkimus – Kohdunkaulan syövän seulonnan uusien merkkiaineiden arvioiminen itse kerätyistä näytteistä (SELFIE)

Maailmanlaajuisesti kohdunkaulansyöpä on edelleen neljänneksi yleisin syöpä ja neljänneksi yleisin syöpäkuolemien syy naisilla. Suurin taakka esiintyy vähäresursseissa olosuhteissa, joissa ei ole tehokasta seulontaa ja hoitoa. Jopa Yhdysvalloissa (Yhdysvallat), jossa Pap-sytologian seulonta on johtanut kohdunkaulan syövän ilmaantuvuuden ja kuolleisuuden dramaattiseen laskuun, tuhansia uusia tapauksia ja niihin liittyviä kuolemantapauksia esiintyy edelleen joka vuosi, yleisimmin heikosti hoidetuilla naisilla, jotka kohtaavat esteitä päästä seulonnan ja /tai hoitoon. Ihmisen papilloomaviruksen (HPV) DNA-testauksen äskettäinen käyttöönotto kohdunkaulan syövän seulonnan ensisijaisena strategiana voi lieventää näitä eroja parantamalla kohdunkaulan esisyövän havaitsemisen herkkyyttä Pap-sytologiaan verrattuna ja tarjoaa samalla paremman pitkän aikavälin varmuuden negatiivisen HPV-testin jälkeen. . Lisäksi HPV-testaus voidaan suorittaa onnistuneesti itse kerätyillä näytteillä, mikä tarjoaa mahdollisuuden laajentaa pääsyä kohdunkaulan syövän seulontaan vaikeasti tavoitettavissa olevien, alipalvettujen naisten keskuudessa.

Huolimatta primaarisen HPV-seulonnan monista eduista, tämänhetkinen haaste on triage-testauksen optimointi sen määrittämiseksi, ketkä monista HPV-positiivisen testin saaneista naisista ovat korkean riskin alaisia ​​ja tarvitsevat välitöntä kolposkopiaan lähetettä tai hoitoa, samalla kun vältetään turhia haittoja vähäriskisille naisille. Molekyylilajittelutesti, joka voidaan suorittaa samasta ensisijaisesta seulontanäytteestä (eli refleksitestaus), on erityisen houkutteleva sekä paljon että vähän resursseja vaativissa asetuksissa, varsinkin jos se toimii itse kerätyistä näytteistä. Aikaisemmin ehdokasisäntäsolugeenien DNA-metylaatiota on arvioitu itse kerätyissä näytteissä, ja se on saavuttanut hyväksyttävän suorituskyvyn HPV-positiivisten naisten luokittelussa. Tutkimuksissa, joissa käytettiin kliinikon keräämiä näytteitä, on ehdotettu, että karsinogeenisten HPV-genotyyppien metylaatiolla on parempi kliininen suorituskyky (korkeampi herkkyys/spesifisyys) verrattuna isäntägeenin metylaatioon; HPV-metylaatiota ei kuitenkaan ole arvioitu itse kerätyissä näytteissä. Koska HPV-DNA:ta esiintyy vain pienessä osajoukossa infektoituneita soluja alemmassa sukupuolielimessä, erityisesti kohdunkaulan esisyövissä, on todennäköistä, että signaali-kohinasuhde itse kerätyissä näytteissä on parempi HPV:lle verrattuna isäntägeenin metylaatioon. parantuneessa kohdunkaulan esisyövän havaitsemisessa. HPV-DNA-metylaatiotestauksen toteutettavuuden arvioiminen itse kerätyistä näytteistä on olennaista määritettäessä, missä määrin tämä määritys voi vastata kriittiseen HPV-lajittelutarpeeseen suuria ja vähän resursseja vaativissa olosuhteissa. Yhteistyössä Cancer Genome Research Laboratoryn kanssa on kehitetty korkean suorituskyvyn ja edullinen seuraavan sukupolven bisulfiittisekvensointimääritys, joka havaitsee 12 karsinogeenisimmän HPV-genotyypin metylaation. Lisäksi tämä määritys sisältää joukon isäntägeenejä, mukaan lukien ne, jotka on aiemmin arvioitu itse kerätyissä näytteissä. Ehdotuksena on testata tätä määritystä parillisilla itse ja kliinikon keräämillä näytteillä 1 000 naisesta, jotka on ilmoittautunut meneillään olevaan prospektiiviseen tutkimukseen naisista, joille tehdään kohdunkaulan syövän seulontaa ja kolposkopiaa George Washingtonin yliopistossa (GWU). Oletuksena on, että HPV:n ja isäntä-DNA:n metylaatio ei osoittanut huonompaa herkkyyttä ja spesifisyyttä kohdunkaulan esisyövän havaitsemiseksi itse kerätyissä näytteissä verrattuna kliinikon keräämiin näytteisiin ja että HPV-metylaatiolla on korkeampi absoluuttinen spesifisyys verrattuna isäntämetylaatioon molemmissa näytetyypeissä.