Badanie selfie — ocena nowych markerów do badań przesiewowych w kierunku raka szyjki macicy na podstawie próbek pobranych samodzielnie (SELFIE)

Na całym świecie rak szyjki macicy pozostaje czwartym najczęściej występującym nowotworem i czwartą najczęstszą przyczyną zgonów z powodu raka wśród kobiet, z największym obciążeniem występującym w środowiskach o niskich zasobach, w których brakuje skutecznych badań przesiewowych i leczenia. Nawet w Stanach Zjednoczonych (USA), gdzie przesiewowe cytologiczne badania cytologiczne doprowadziły do ​​dramatycznego spadku zachorowalności i śmiertelności na raka szyjki macicy, każdego roku nadal pojawiają się tysiące nowych przypadków i związanych z nimi zgonów, najczęściej wśród kobiet o niedostatecznym leczeniu, które napotykają bariery w dostępie do badań przesiewowych i /lub leczenie. Niedawne wdrożenie testów DNA na wirusa brodawczaka ludzkiego (HPV) jako podstawowej strategii badań przesiewowych w kierunku raka szyjki macicy może potencjalnie zmniejszyć te rozbieżności poprzez poprawę czułości wykrywania stanu przedrakowego szyjki macicy w porównaniu z cytologią cytologiczną, zapewniając jednocześnie większą długoterminową pewność po ujemnym teście HPV . Co więcej, testy na HPV można z powodzeniem przeprowadzać na próbkach pobranych samodzielnie, co daje możliwość poszerzenia dostępu do badań przesiewowych w kierunku raka szyjki macicy wśród trudno dostępnych, niedostatecznie leczonych kobiet.

Pomimo wielu zalet pierwotnego badania przesiewowego w kierunku HPV, obecnym wyzwaniem jest optymalizacja testów segregacyjnych w celu określenia, które spośród wielu kobiet z pozytywnym wynikiem testu na HPV znajdują się w grupie wysokiego ryzyka i wymagają natychmiastowego skierowania na kolposkopię lub leczenia, przy jednoczesnym uniknięciu niepotrzebnych szkód wśród kobiet z grupy niskiego ryzyka. Test segregacji molekularnej, który można przeprowadzić z tej samej pierwotnej próbki przesiewowej (tj. Test odruchowy), jest szczególnie atrakcyjny zarówno w przypadku ustawień o wysokich, jak i niskich zasobach, szczególnie jeśli działa na podstawie próbek pobranych samodzielnie. Wcześniej metylacja DNA kandydujących genów komórek gospodarza była oceniana w próbkach pobranych przez siebie i osiągała akceptowalną wydajność dla segregacji kobiet HPV-dodatnich. W badaniach z wykorzystaniem próbek pobranych przez klinicystów sugeruje się, że metylacja rakotwórczych genotypów HPV ma lepszą skuteczność kliniczną (wyższa czułość/swoistość) w porównaniu z metylacją genów gospodarza; jednakże metylacja HPV nie została oceniona w próbkach pobranych samodzielnie. Ponieważ DNA HPV jest obecne tylko w niewielkiej podgrupie zakażonych komórek w dolnych drogach rodnych, szczególnie w stanach przedrakowych szyjki macicy, jest prawdopodobne, że stosunek sygnału do szumu w próbkach pobranych samodzielnie jest lepszy dla HPV w porównaniu z metylacją genu gospodarza, co skutkuje w ulepszonej specyficzności wykrywania stanu przedrakowego szyjki macicy. Ocena wykonalności testów metylacji DNA HPV z próbek pobranych samodzielnie jest niezbędna do określenia, w jakim stopniu ten test może zaspokoić krytyczną potrzebę segregacji HPV w warunkach o wysokich i niskich zasobach. We współpracy z Cancer Genome Research Laboratory opracowano wysokowydajny, niedrogi test sekwencjonowania wodorosiarczynem nowej generacji, który wykrywa metylację 12 najbardziej rakotwórczych genotypów HPV. Co więcej, ten test obejmuje panel genów gospodarza, w tym te, które zostały wcześniej ocenione w próbkach pobranych przez siebie. Proponuje się przetestowanie tego testu w parach próbek pobranych samodzielnie i przez klinicystów od 1000 kobiet włączonych do trwającego prospektywnego badania kobiet poddawanych badaniom przesiewowym i kolposkopii w kierunku raka szyjki macicy na Uniwersytecie George'a Washingtona (GWU). Hipoteza jest taka, że ​​metylacja HPV i DNA gospodarza będzie wykazywać nie mniejszą czułość i swoistość w wykrywaniu stanu przedrakowego szyjki macicy w próbkach pobranych samodzielnie w porównaniu z próbkami pobranymi przez klinicystę oraz że metylacja HPV będzie miała wyższą absolutną specyficzność w porównaniu z metylacją gospodarza w obu typach próbek.