Kiinnostus kiertävästä kasvain-DNA:sta ruuansulatus- ja gynekologisessa/rintasyövässä

Kiertävä kasvain-DNA (ctDNA) tarjoaa mahdollisuuden päästä kasvaimen genomiin kiertävästä verestä yksinkertaisen verikokeen avulla. Sitä käytetään tällä hetkellä diagnostisiin, prognostisiin ja ennustaviin tarkoituksiin onkologisten hoitojen vasteen tai resistenssin osalta. Nämä edistysaskeleet ctDNA:ssa ovat mahdollisia molekyylibiologian tekniikoiden viime vuosien suuren kehityksen ansiosta, koska ctDNA:n havaitseminen vaatii erittäin herkkiä tekniikoita, kuten seuraavan sukupolven sekvensointia (NGS).

CtDNA voittaa tämän tuumorin heterogeenisyyden erittäin rajoittavan ongelman kiinteän biopsian aikana. Kaikki nämä sovellukset tekevät kiertävästä DNA:sta yhä tärkeämmän työkalun syöpäpotilaiden hoidossa. Tutkimukset ovat tällä hetkellä useimmiten pieniä määriä ja ovat retrospektiivisia.

Lisäksi eksosomit ovat myös tulevaisuuden biomarkkeri, joka voidaan havaita myös verenkierrossa. Eksosomit ovat halkaisijaltaan 50-200 nm:n nanovesikkelejä, jotka vapautuvat solunulkoiseen ympäristöön endosomaalisen reitin kautta fuusioimalla plasmakalvon kanssa. Ne ovat erittäin informatiivisia, koska ne kuljettavat kasvaimen geneettistä materiaalia DNA:n, mRNA:n ja miRNA:n muodossa, mutta myös adheesioproteiineja, immunostimulatorisia molekyylejä ja sytoskeletonia, entsyymejä ja Heats shock -proteiineja (HSP).

ADIGYN-tutkimuksen tavoitteena on koota laaja potentiaalinen kohortti arvioimaan ctDNA:n ja eksosomien diagnostista, prognostista ja ennustavaa vaikutusta ruoansulatuskanavan ja gynekologisiin/rintasyöpiin. Kierrättävästä DNA:sta karakterisoimme ActDNA:ta molekyylitasolla erilaisten tavallisesti käytettyjen pistemutaatioiden, mutta myös uusien kuvattujen, terapeuttisesti vaikuttavien mutaatioiden tutkimuksen ja muiden terapeuttiseen strategiaan vaikuttavien geneettisten muutosten (esim. mikrosatelliittien epävakaus) tai eksosomien ja niiden koostumuksen tutkiminen. Onkologisille hoidoille vastustuskyvyn arvioimiseksi ctDNA analysoidaan hoidon alussa, hoidon aikana, etenemisen ja/tai uusiutumisen aikana sekä myös seurannan tai hoitotauon aikana.