Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Välimeren ruokavalio ja painonpudotus: Sappihappo/suolistomikrobiomi-akselin kohdistaminen kolorektaalisyövän vähentämiseen (Bridge CRC)

tiistai 11. huhtikuuta 2023 päivittänyt: Lisa Tussing-Humphreys, University of Illinois at Chicago
Välimeren ruokavalio (MedDiet), joka on suurelta osin kasvipohjainen ruokavalio, on merkityksellinen CRC:n ehkäisyssä ja syövän vastaisten metaboliittien mikrobituotannossa havainnointitutkimuksissa. MedDiet voi muuttaa BA-aineenvaihduntaa kädellisten osoittamalla tavalla, ja yhdistettynä kalorirajoitukseen osoittaa erinomaisen tarttuvuuden ja painonhallinnan ihmisillä sen maun vuoksi. Tähän mennessä yksikään tutkimus ei ole testannut RCT:llä pelkän MedDietin (MedA), WL:n vaikutuksia elämäntapainterventioihin (WL-A) tai kalorirajoitetun MedDietin (WL-Med) vaikutuksia BA-suolen mikrobiomiakseliin ja sen merkitys CRC:n ehkäisyyn AA:iden keskuudessa. Monitieteinen tiimi, joka yhdistää psykologian, ravitsemuksen, mikrobiologian, molekyylisolubiologian, laskennallisen biologian, lääketieteen ja biostatistian asiantuntemuksen, ehdottaa neljän käden RCT:tä, jossa 180 lihavaa AA:ta, 45–75 vuotta, suorittaa yhden seuraavista 6 kuukautta interventiot: Med-A, paino vakaa; WL-A, kalorirajoitus ilman ruokavalion muutosta; WLMed; tai Control. Tutkijat käyttävät lähtötilanteessa, tutkimuksen puolivälissä (kuukausi-3) ja toimenpiteen jälkeen kerättyjä näytteitä ja tietoja vertaillakseen interventioiden vaikutuksia 1) verenkierrossa ja ulosteessa olevien BA:iden pitoisuuteen ja koostumukseen; 2) Suoliston mikrobiota ja aineenvaihduntatoiminta; ja 3) kuoriutuneiden suolen epiteelisolujen geeniekspressioprofiilit.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Rekrytointi

Ehdot

Interventio / Hoito

Yksityiskohtainen kuvaus

Kolorektaalisyöpään (CRC) liittyy useita riskitekijöitä, mukaan lukien liikalihavuus, vähäkuituinen ruokavalio sekä runsaasti eläinproteiinia ja tyydyttynyttä rasvaa (SFat) sisältävät ruokavaliot. Afroamerikkalaisilla (AA) on suurempi näiden riskitekijöiden esiintyvyys, ja heillä on korkein CRC-tauti ja siihen liittyvä kuolleisuus. Nämä useat riskitekijät liittyvät myös korkeampaan verenkiertoon ja ulosteen sappihappoihin (BA) ja BA:n aminohappokonjugaation siirtymiseen glysiinistä tauriiniin. Nämä BA:hen liittyvät muutokset voivat muuttaa suolen mikrobiotan koostumusta, rakennetta ja metabolista aktiivisuutta, mikä edistää suolistobakteerien olosuhteita laajentaa ja metaboloida tauriinikonjugoituja BA:ita genotoksiseksi rikkivetyksi (H2S) ja kasvaimen promoottoriksi, deoksikoolihapoksi (DCA). ; paksusuolen miljöö, joka edistää CRC:n muodostumista. Tutkijat ovat osoittaneet, että H2S:ää tuottavien bakteerien määrä on huomattavasti suurempi AA:n paksusuolessa verrattuna ei-latinalaisamerikkalaisiin valkoisiin (NHW) ja se on AA CRC -tapausten joukossa määrittelevä piirre, mikä viittaa siihen, että nämä bakteerit osallistuvat CRC:n kehitykseen rodussa. riippuvaisella tavalla. Lisäksi mikrobien ero liittyy suurempaan SFat:n ja eläinproteiinin saantiin AA:ssa, mikä tarjoaa keskeisen interventiokohteen. Tutkijat olettavat, että BA-suolen mikrobiomiakselin kohdistaminen H2S:ää ja DCA:ta tuottavien bakteerien runsauden, kasvun ja metabolisen aktiivisuuden tukahduttamiseen ruokavalion ja painonpudotuksen (WL) avulla voi vähentää CRC-riskiä erityisesti AA:iden keskuudessa. Välimeren ruokavalio (MedDiet), joka on suurelta osin kasvipohjainen ruokavalio, on merkityksellinen CRC:n ehkäisyssä ja syövän vastaisten metaboliittien mikrobituotannossa havainnointitutkimuksissa. MedDiet voi muuttaa BA-aineenvaihduntaa kädellisten osoittamalla tavalla, ja yhdistettynä kalorirajoitukseen osoittaa erinomaisen tarttuvuuden ja painonhallinnan ihmisillä sen maun vuoksi. Tähän mennessä yksikään tutkimus ei ole testannut RCT:llä pelkän MedDietin (MedA), WL:n vaikutuksia elämäntapainterventioihin (WL-A) tai kalorirajoitetun MedDietin (WL-Med) vaikutuksia BA-suolen mikrobiomiakseliin ja sen merkitys CRC:n ehkäisyyn AA:iden keskuudessa. Monitieteinen tiimimme, jossa yhdistyvät psykologian, ravitsemuksen, mikrobiologian, molekyylisolubiologian, laskennallisen biologian, lääketieteen ja biostatistian asiantuntemus, ehdottaa neljän käden RCT:tä, jossa 180 lihavaa AA:ta, iältään 45–75 vuotta, suorittaa yhden seuraavista 6 kuukautta interventiot: Med-A, paino vakaa; WL-A, kalorirajoitus ilman ruokavalion muutosta; WLMed; tai Control. Tutkijat käyttävät lähtötilanteessa, tutkimuksen puolivälissä (kuukausi-3) ja toimenpiteen jälkeen kerättyjä näytteitä ja tietoja vertaillakseen interventioiden vaikutuksia 1) verenkierrossa ja ulosteessa olevien BA:iden pitoisuuteen ja koostumukseen; 2) Suoliston mikrobiota ja aineenvaihduntatoiminta; ja 3) kuoriutuneiden suolen epiteelisolujen geeniekspressioprofiilit. Tutkijoiden lähestymistapa on vahva, kun otetaan huomioon monitieteinen tiimi, näyttöön perustuvien elämäntapainterventioiden käyttö ja kehittyneet -omiikka-analyysit, joilla tutkitaan ruokavalion/WL:n, suoliston mikrobiomin ja isännän suoliston fysiologian välistä ylikuulumista. Jos tämä tutkimus onnistuu, sillä voi olla syvällinen kansanterveysvaikutus CRC-riskiin AA:iden ja muiden riskiryhmien keskuudessa, mikä johtaisi oikea-aikaisiin levitysmahdollisuuksiin.

Opintotyyppi

Interventio

Ilmoittautuminen (Odotettu)

232

Vaihe

  • Ei sovellettavissa

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

  • Yhdysvallat
    • Illinois
      • Chicago, Illinois, Yhdysvallat, 60612
        • Rekrytointi
        • University of Illinois at Chicago

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

45 vuotta - 75 vuotta (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Joo

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Miehet ja naiset 45-75 vuotiaat
  • Tunnista itsesi AA
  • BMI 30-50 kg/m2
  • Halu osallistua kaikkiin toimenpiteisiin, mukaan lukien painon ylläpitäminen / nykyinen fyysinen aktiivisuus, jos satunnaistetaan Med-A/Controliin
  • Halukkuus antaa tietoinen suostumus
  • Halukkuus satunnaisiin
  • Ymmärtää englantia
  • On pääsy puhelimeen
  • Aikoo oleskella Chicagossa seuraavat 8-10 kuukautta.

Poissulkemiskriteerit:

  • munuaissairaus
  • autoimmuunihäiriöt
  • immuunipuutos
  • imeytymishäiriöt
  • merkittävät ruoansulatuskanavan ja/tai maksan sairaudet
  • vakava iskeeminen sydänsairaus
  • vakava keuhkosairaus
  • bariatrisen leikkauksen historia
  • alkoholin väärinkäyttö (> 50 grammaa/päivä)
  • laittomien huumeiden väärinkäyttö (muu kuin marihuana itseraportin perusteella)
  • palavan tupakan käyttöä
  • hallitsematon diabetes, joka perustuu HbA1c> 9,0 %
  • syömishäiriö
  • syöpähoitoa viimeisen 12 kuukauden aikana
  • CRC:n historia
  • geneettinen alttius CRC:lle (esim. Lynchin oireyhtymä)
  • kävelyhäiriö
  • paino > 450 lbs. (DXA-skannerin painorajoitus)
  • noudattaa tällä hetkellä ruokavalioseulontaan perustuvaa MedDietiä
  • itse ilmoittanut WL > 3 % viimeisen 12 kuukauden aikana
  • tällä hetkellä WL-ruokavaliolla tai aktiivisesti mukana virallisessa WL-ohjelmassa (esim. Painonvartijat)
  • ruoka-aineallergiat, jotka häiritsevät MedDietin hyväksymistä
  • antibioottien käyttö viimeisen 3 kuukauden aikana
  • yövuorotyötä
  • prebioottien/probioottien/synbioottien, ravintolisän tai laksatiivien säännöllinen käyttö (eli ≥ 3 kertaa viikossa),
  • tällä hetkellä raskaana
  • aktiivinen Covid-19-infektio 6 viikon sisällä värväyksestä/tietojen keruusta.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Ensisijainen käyttötarkoitus: Ennaltaehkäisy
  • Jako: Satunnaistettu
  • Inventiomalli: Rinnakkaistehtävä
  • Naamiointi: Yksittäinen

Aseet ja interventiot

Osallistujaryhmä / Arm
Interventio / Hoito
Kokeellinen: WL-Med

WL-Med osallistuu tunnin kestävään henkilökohtaiseen istuntoon rekisteröidyn ravitsemusterapeutin (RD) kanssa ennen toimenpidettä. RD ohjaa syömismallia, joka on yhdenmukainen MedDietin kanssa yksilöllisen vaihtoluettelon avulla. Vaihto perustuu yksilöllisiin kaloritarpeisiin painon pudottamiseksi (WL-Med, kalorirajoitus 1-2 paunaan viikossa WL:n ja 5 % WL:n saavuttamiseksi lähtötasosta 6 kuukauden kohdalla). Emme pyydä koehenkilöitä pidättäytymään alkoholista huolimatta sen tunnetuista vaikutuksista BA-aineenvaihduntaan, mutta suosittelemme, että vain 5 % kaloreista tulee aterioiden yhteydessä nautitusta alkoholista. Alkuistunnon jälkeen koehenkilöt tapaavat etänä tai henkilökohtaisesti 24 yksittäisen istunnon aikana (1 tunti, noin viikoittain). Lisää asynkronisia oppimateriaaleja jaetaan viikoittain yksityisen Facebook-ryhmän kautta.

WL-Med-ryhmälle määrätään toimintaohjelma. Jotkut asynkroniset oppitunnit sisältävät tietoa fyysisestä aktiivisuudesta. Fyysistä aktiivisuutta seurataan FitBitin kautta.
Muut: Med
Välimeren ruokavalio
Muut: WL
Painon muutoksen mittaaminen
Ei väliintuloa: Ohjaus
Tutkimus-RD tapaa henkilökohtaisesti kontrolliryhmän koehenkilöt henkilökohtaisesti 1 tunnin ajan kuuden kuukauden intervention alussa. Kontrollin osallistujia ohjeistetaan säilyttämään nykyiset syömis- ja aktiivisuustavat sekä paino seuraavan kuuden kuukauden ajan. Ravitsemussuosituksia ei anneta, ja he saavat viikoittain terveysuutiskirjeitä, jotka sisältävät ruokavalioon liittymättömiä terveysaiheita (esim. flunssan ehkäisy). Yhteydenotot otetaan uudelleen kuukauden 3 ja hoidon jälkeisillä (kuu 6) tutkimuskäynneillä sekä kuukausittaisilla puheluilla kerätäkseen tietoja viimeaikaisesta ruokavalion saannista. Kuukauden 3 arvioinnissa paino tarkistetaan ja ne, joiden WL on > 2,5 % lähtötasosta, saavat lisäohjeita RD:ltä elämäntapamallien ylläpitämiseksi. Kaikki WL-Med-materiaalit tarjotaan ryhmälle itseohjatussa muodossa 6 kuukauden intervention jälkeen.
Kokeellinen: Med-A

Med-A osallistuu tunnin kestävään henkilökohtaiseen istuntoon rekisteröidyn ravitsemusterapeutin (RD) kanssa kahden viikon aikana ennen toimenpiteen alkamista. Med-A:han satunnaistetuille koehenkilöille RD-tutkimus opastaa MedDietin mukaisen syömismallin omaksumista yksilöllisen MedDiet-vaihtoluettelon ja kumppanioppaan avulla. Suositeltavat päivittäiset vaihdot perustuvat yksilöllisiin kaloritarpeisiin painon ylläpitämiseksi. Emme pyydä koehenkilöitä pidättäytymään alkoholista kokeen aikana huolimatta sen tunnetuista vaikutuksista BA-aineenvaihduntaan, mutta suosittelemme, että vain 5 % kaloreista tulee aterioiden yhteydessä nautitusta alkoholista. Ensimmäisen istunnon jälkeen koehenkilöt tapaavat 24 yksittäistä istuntoa (1 tunti, noin viikoittain) henkilökohtaisesti tai käytännössä jäljellä olevien 6 kuukauden aikana. Lisää asynkronisia oppimateriaaleja jaetaan viikoittain yksityisen Facebook-ryhmän kautta.

Med-A-ryhmää pyydetään jatkamaan tavallista fyysistä aktiivisuuttaan.
Muut: Med
Välimeren ruokavalio
Kokeellinen: WL-A

WL-A osallistuu tunnin kestävään henkilökohtaiseen istuntoon rekisteröidyn ravitsemusterapeutin (RD) kanssa interventiota edeltävien kahden viikon aikana. WL-A:ssa painopiste on päivittäisessä kalorirajoituksessa (-500-750 kcal/päivä), jotta saavutetaan 1-2 paunaa viikossa WL ja 5 % WL lähtötasosta kuuden kuukauden kohdalla koehenkilön tyypillisen ruokavalion yhteydessä. kuvio. Emme pyydä koehenkilöitä pidättäytymään alkoholista kokeen aikana huolimatta sen tunnetuista vaikutuksista BA-aineenvaihduntaan, mutta suosittelemme, että vain 5 % kaloreista tulee aterioiden yhteydessä nautitusta alkoholista. Ensimmäisen istunnon jälkeen koehenkilöt kokoontuvat 24 henkilökohtaiseen, virtuaaliseen tai henkilökohtaiseen istuntoon (1 tunti, noin viikoittain) jäljellä olevien 6 kuukauden aikana. Lisää asynkronisia oppimateriaaleja jaetaan viikoittain yksityisen Facebook-ryhmän kautta.

WL-A-ryhmälle määrätään toimintaohjelma. Fyysistä aktiivisuutta seurataan FitBitin kautta.
Muut: WL
Painon muutoksen mittaaminen

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Verenkierron ja ulosteen sappihapot
Aikaikkuna: perusviiva
Lähtötilanteessa saadun ulosteen ja seerumin BA:iden absoluuttinen mittaus suoritetaan Co-I Ridlonin ohjauksessa. Näytteet uutetaan ja supernatantit kuivataan ja suspendoidaan uudelleen LC/MS-analyysiä varten validoitujen ja julkaistujen menetelmien mukaisesti. Kvantifioimme kaikki tärkeimmät primaariset ja sekundaariset BA:t (esim. DCA) ja glysiini- ja tauriinikonjugaatit ja niiden suhteet sekä BA:iden kokonaismäärät ja konjugoimattomien BA:iden kokonaismäärät. Aidot viite-BA:t hankitaan Sigma-Aldrichilta ja Steraloidsilta. Erien välisen ja sisäisen tarkkuuden arvioimiseen käytetään sokeita kaksoisnäytteitä.
perusviiva
Verenkierron ja ulosteen sappihapot
Aikaikkuna: 3 kuukautta
BA:iden absoluuttinen mittaus ulosteessa ja seerumissa, jotka on saatu tutkimuksen puolivälissä (3 kuukauden seuranta) suoritetaan Co-I Ridlonin johdolla. Näytteet uutetaan ja supernatantit kuivataan ja suspendoidaan uudelleen LC/MS-analyysiä varten validoitujen ja julkaistujen menetelmien mukaisesti. Kvantifioimme kaikki tärkeimmät primaariset ja sekundaariset BA:t (esim. DCA) ja glysiini- ja tauriinikonjugaatit ja niiden suhteet sekä BA:iden kokonaismäärät ja konjugoimattomien BA:iden kokonaismäärät. Aidot viite-BA:t hankitaan Sigma-Aldrichilta ja Steraloidsilta. Erien välisen ja sisäisen tarkkuuden arvioimiseen käytetään sokeita kaksoisnäytteitä.
3 kuukautta
Verenkierron ja ulosteen sappihapot
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Intervention jälkeen (6 kuukauden seuranta) saatujen ulosteiden ja seerumin absoluuttinen mittaus suoritetaan Co-I Ridlonin johdolla. Näytteet uutetaan ja supernatantit kuivataan ja suspendoidaan uudelleen LC/MS-analyysiä varten validoitujen ja julkaistujen menetelmien mukaisesti. Kvantifioimme kaikki tärkeimmät primaariset ja sekundaariset BA:t (esim. DCA) ja glysiini- ja tauriinikonjugaatit ja niiden suhteet sekä BA:iden kokonaismäärät ja konjugoimattomien BA:iden kokonaismäärät. Aidot viite-BA:t hankitaan Sigma-Aldrichilta ja Steraloidsilta. Erien välisen ja sisäisen tarkkuuden arvioimiseen käytetään sokeita kaksoisnäytteitä.
6 kuukautta
Suoliston mikrobiota aineenvaihduntaan
Aikaikkuna: perusviiva
UIC Genomics -ydin PCR monistaa genomisen DNA:n alukkeilla CS1_515F ja CS2_806R (muokattu Earth Microbiome Projectin käyttämästä sarjasta), jotka kohdistuvat mikrobien pienten alayksiköiden ribosomaalisten RNA-geenien V4-alueeseen. Amplikonit luodaan käyttämällä kaksivaiheista PCR-protokollaa. 16S-rRNA-geenin V4-alue sekvensoidaan Illumina MiSeq -alustalla 2 x 250 bp:n parillisen pään lukujen luomiseksi näytettä kohti. Sekvensseihin sisällytetään ympäristökontrollit, jotta ne voidaan erottaa kaikista reagensseissa tai laboratorioympäristössä olevista kontaminanteista.
perusviiva
Suoliston mikrobiota aineenvaihduntaan
Aikaikkuna: 3 kuukautta
UIC Genomics -ydin PCR monistaa genomisen DNA:n alukkeilla CS1_515F ja CS2_806R (muokattu Earth Microbiome Projectin käyttämästä sarjasta), jotka kohdistuvat mikrobien pienten alayksiköiden ribosomaalisten RNA-geenien V4-alueeseen. Amplikonit luodaan käyttämällä kaksivaiheista PCR-protokollaa. 16S-rRNA-geenin V4-alue sekvensoidaan Illumina MiSeq -alustalla 2 x 250 bp:n parillisen pään lukujen luomiseksi näytettä kohti. Sekvensseihin sisällytetään ympäristökontrollit, jotta ne voidaan erottaa kaikista reagensseissa tai laboratorioympäristössä olevista kontaminanteista.
3 kuukautta
Suoliston mikrobiota aineenvaihduntaan
Aikaikkuna: 6 kuukautta
UIC Genomics -ydin PCR monistaa genomisen DNA:n alukkeilla CS1_515F ja CS2_806R (muokattu Earth Microbiome Projectin käyttämästä sarjasta), jotka kohdistuvat mikrobien pienten alayksiköiden ribosomaalisten RNA-geenien V4-alueeseen. Amplikonit luodaan käyttämällä kaksivaiheista PCR-protokollaa. 16S-rRNA-geenin V4-alue sekvensoidaan Illumina MiSeq -alustalla 2 x 250 bp:n parillisen pään lukujen luomiseksi näytettä kohti. Sekvensseihin sisällytetään ympäristökontrollit, jotta ne voidaan erottaa kaikista reagensseissa tai laboratorioympäristössä olevista kontaminanteista.
6 kuukautta
Geenien ilmentyminen
Aikaikkuna: perusviiva
Ambion Denaturation Solution -liuoksessa säilötystä ulosteesta eristetään eukaryoottinen polyA+-RNA käyttämällä Active Motif mTRAP Maxi -pakkausta, minkä jälkeen DNA poistetaan DNAFreellä (Invitrogen). Kirjastot kvantifioidaan käyttämällä Library Quantification -pakkausta (Kapa Biosystems), ja sekvensointi suoritetaan Illumina HiSeq 2500 -alustalla käyttämällä tavallisia Illumina-protokollia. RNA-lukemat kartoitetaan STAR-kohdistuslaitteella käyttämällä oletusparametreja Ensembl GRCh38 -ihmisreferenssiin. Lukemat tutkitaan laadunvalvontaa varten FastQC:n avulla ja kvantifioidaan HTSeq-countilla. Sekvensointilukemat suodatetaan vähäisenä esiintyvien geenien poistamiseksi. Ulosteen kuoriutuneiden solujen osalta RNA-seq-geenin määrämatriisi on hyvin harvalukuinen, ja useimmat merkinnät vastaavat nollatranskriptejä; Siten ulosteessa olevat geenit poistetaan, jos > 33 % näytteistä sisältää vain 0 tai 1 lukemaa.
perusviiva
Geenien ilmentyminen
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Ambion Denaturation Solution -liuoksessa säilötystä ulosteesta eristetään eukaryoottinen polyA+-RNA käyttämällä Active Motif mTRAP Maxi -pakkausta, minkä jälkeen DNA poistetaan DNAFreellä (Invitrogen). Kirjastot kvantifioidaan käyttämällä Library Quantification -pakkausta (Kapa Biosystems), ja sekvensointi suoritetaan Illumina HiSeq 2500 -alustalla käyttämällä tavallisia Illumina-protokollia. RNA-lukemat kartoitetaan STAR-kohdistuslaitteella käyttämällä oletusparametreja Ensembl GRCh38 -ihmisreferenssiin. Lukemat tutkitaan laadunvalvontaa varten FastQC:n avulla ja kvantifioidaan HTSeq-countilla. Sekvensointilukemat suodatetaan vähäisenä esiintyvien geenien poistamiseksi. Ulosteen kuoriutuneiden solujen osalta RNA-seq-geenin määrämatriisi on hyvin harvalukuinen, ja useimmat merkinnät vastaavat nollatranskriptejä; Siten ulosteessa olevat geenit poistetaan, jos > 33 % näytteistä sisältää vain 0 tai 1 lukemaa.
3 kuukautta
Geenien ilmentyminen
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Ambion Denaturation Solution -liuoksessa säilötystä ulosteesta eristetään eukaryoottinen polyA+-RNA käyttämällä Active Motif mTRAP Maxi -pakkausta, minkä jälkeen DNA poistetaan DNAFreellä (Invitrogen). Kirjastot kvantifioidaan käyttämällä Library Quantification -pakkausta (Kapa Biosystems), ja sekvensointi suoritetaan Illumina HiSeq 2500 -alustalla käyttämällä tavallisia Illumina-protokollia. RNA-lukemat kartoitetaan STAR-kohdistuslaitteella käyttämällä oletusparametreja Ensembl GRCh38 -ihmisreferenssiin. Lukemat tutkitaan laadunvalvontaa varten FastQC:n avulla ja kvantifioidaan HTSeq-countilla. Sekvensointilukemat suodatetaan vähäisenä esiintyvien geenien poistamiseksi. Ulosteen kuoriutuneiden solujen osalta RNA-seq-geenin määrämatriisi on hyvin harvalukuinen, ja useimmat merkinnät vastaavat nollatranskriptejä; Siten ulosteessa olevat geenit poistetaan, jos > 33 % näytteistä sisältää vain 0 tai 1 lukemaa.
6 kuukautta
Kuoriutuneen suolen epiteelisolujen transkriptomiikka
Aikaikkuna: Perustaso
Kuoritut suolen epiteelisolut erotettiin ulosteesta geeniekspressioanalyysillä
Perustaso
Kuoriutuneen suolen epiteelisolujen transkriptomiikka
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Kuoritut suolen epiteelisolut erotettiin ulosteesta geeniekspressioanalyysillä
3 kuukautta
Kuoriutuneen suolen epiteelisolujen transkriptomiikka
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Kuoritut suolen epiteelisolut erotettiin ulosteesta geeniekspressioanalyysillä
6 kuukautta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Kehon paino
Aikaikkuna: perusviiva
Paino mitataan digitaalisella vaa'alla
perusviiva
Painoindeksi
Aikaikkuna: perusviiva
Laskettu mitatun painon ja pituuden perusteella
perusviiva
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Perustaso
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Perustaso
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Kuukausi 1
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Kuukausi 1
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Kuukausi 2
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Kuukausi 2
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Kuukausi 3
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Kuukausi 3
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Kuukausi 4
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Kuukausi 4
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Kuukausi 5
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Kuukausi 5
Välimeren ruokavalion noudattaminen
Aikaikkuna: Kuukausi 6
Mitataan ruokatiheyskyselyllä, 24 tunnin ruokavalion muistutuksella ja seulonnalla, jotka kootaan arvioimaan kokonaissyötymispisteet
Kuukausi 6
Liikunta
Aikaikkuna: Perustaso
Askelmäärä mitattuna 7 päivän aikana puettavan FitBit-seurantalaitteen avulla
Perustaso
Koko ja alueellinen kehon koostumus (rasva ja lihakset)
Aikaikkuna: perusviiva
Koko kehon koostumuksen DXA-skannaus koko kehon koostumuksen mittaamiseksi rasva% vs. luu% vs. laiha%
perusviiva
Kiertyvät sytokiinit
Aikaikkuna: Perustaso
Mitattu seerumista kaupallisella multipleksisarjalla
Perustaso
Paastoglukoosi
Aikaikkuna: Perustaso
Mitattu plasmasta paikallisessa kaupallisessa laboratoriossa
Perustaso
Paastoinsuliini
Aikaikkuna: Perustaso
Mitattu plasmasta paikallisessa kaupallisessa laboratoriossa
Perustaso
Kehon paino
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Paino mitataan digitaalisella vaa'alla
3 kuukautta
Kehon paino
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Paino mitataan digitaalisella vaa'alla
6 kuukautta
Painoindeksi
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Laskettu mitatun painon ja pituuden perusteella
3 kuukautta
Painoindeksi
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Laskettu mitatun painon ja pituuden perusteella
6 kuukautta
Liikunta
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Askelmäärä mitattuna 7 päivän aikana puettavan FitBit-seurantalaitteen avulla
3 kuukautta
Liikunta
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Askelmäärä mitattuna 7 päivän aikana puettavan FitBit-seurantalaitteen avulla
6 kuukautta
Koko ja alueellinen kehon koostumus (rasva ja lihakset)
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Koko kehon koostumuksen DXA-skannaus koko kehon koostumuksen mittaamiseksi rasva% vs. luu% vs. laiha%
3 kuukautta
Koko ja alueellinen kehon koostumus (rasva ja lihakset)
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Koko kehon koostumuksen DXA-skannaus koko kehon koostumuksen mittaamiseksi rasva% vs. luu% vs. laiha%
6 kuukautta
Kiertyvät sytokiinit
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Mitattu seerumista kaupallisella multipleksisarjalla
3 kuukautta
Kiertyvät sytokiinit
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Mitattu seerumista kaupallisella multipleksisarjalla
6 kuukautta
Paastoglukoosi
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Mitattu plasmasta paikallisessa kaupallisessa laboratoriossa
3 kuukautta
Paastoglukoosi
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Mitattu plasmasta paikallisessa kaupallisessa laboratoriossa
6 kuukautta
Paastoinsuliini
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Mitattu plasmasta paikallisessa kaupallisessa laboratoriossa
3 kuukautta
Paastoinsuliini
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Mitattu plasmasta paikallisessa kaupallisessa laboratoriossa
6 kuukautta

Muut tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Psykososiaalinen terveys
Aikaikkuna: Perustaso
kyselyyn
Perustaso
Lääkkeiden käyttö
Aikaikkuna: perusviiva
Kysely, haastattelu
perusviiva
Suolistotottumukset
Aikaikkuna: perusviiva
kyselyyn
perusviiva
Vastoinkäymiset
Aikaikkuna: Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 6 kuukautta
Hankittu haastattelun kautta
Opintojen suorittamisen aikana keskimäärin 6 kuukautta
Psykososiaalinen terveys
Aikaikkuna: 3 kuukautta
kysely
3 kuukautta
Psykososiaalinen terveys
Aikaikkuna: 6 kuukautta
kysely
6 kuukautta
Lääkkeiden käyttö
Aikaikkuna: 3 kuukautta
Kysely, haastattelu
3 kuukautta
Lääkkeiden käyttö
Aikaikkuna: 6 kuukautta
Kysely, haastattelu
6 kuukautta
Suolistotottumukset
Aikaikkuna: 3 kuukautta
kysely
3 kuukautta
Suolistotottumukset
Aikaikkuna: 6 kuukautta
kysely
6 kuukautta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

University of Illinois at Chicago

Yhteistyökumppanit

National Cancer Institute (NCI)

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Tiistai 1. helmikuuta 2022

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Sunnuntai 31. maaliskuuta 2024

Opintojen valmistuminen (Odotettu)

Maanantai 31. maaliskuuta 2025

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Perjantai 29. tammikuuta 2021

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Keskiviikko 10. helmikuuta 2021

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Maanantai 15. helmikuuta 2021

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Torstai 13. huhtikuuta 2023

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 11. huhtikuuta 2023

Viimeksi vahvistettu

Lauantai 1. huhtikuuta 2023

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 2020-1342
  • 1R01CA250390-01A1 (Yhdysvaltain NIH-apuraha/sopimus)

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Peräsuolen syöpä

Kliiniset tutkimukset Med

Hae vastaavia kokeiluja

Sponsorit ja yhteistyökumppanit

Sairaudet

Huumeiden interventiot

CROs by country

CROs in Kazakhstan

Ehdot

Harvinaiset sairaudet

Huumeiden interventiot

Ravintolisät

Sponsori / yhteistyökumppanit

Sijainnit

3
Tilaa