Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Következő generációs szekvenálás a gyomor-bélrendszeri rákban

2018. június 28. frissítette: Fujian Cancer Hospital
A folyékony biopsziát sikeresen alkalmazták a rák kezelésében és diagnosztizálásában. A cfDNS-nek egyre nagyobb figyelmet szentelnek a folyékony biopsziában. Korábbi tanulmányok kimutatták, hogy a cfDNS felhasználható a sugár- vagy kemoterápia hatékonyságának előrejelzésére tüdőrák, végbélrák és nyelőcsőrák esetén. Azt is közölték, hogy a cfDNS felhasználható előrehaladott gyomorrák posztoperatív kiújulásának értékelésére. Azonban nem számoltak be az NGS használatáról a cfDNS kimutatására gasztrointesztinális daganatokban. A tanulmány célja a cfDNS, a cfDNS tumor buden és az előrehaladott gasztrointesztinális traktus daganatos betegek közötti összefüggés vizsgálata, valamint az előrehaladott gasztrointesztinális traktus daganat prognózis génjének meghatározása.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Ismeretlen

Körülmények

Beavatkozás / kezelés

Részletes leírás

Minta DNS-kezelés: Perifériás vér limfocitákat (PBL-eket) és plazmát gyűjtöttünk elemzés céljából minden egyes betegnél. EDTA hozzáadásával vérmintákat tartalmazó 10 ml-es csöveket 1000 g-vel centrifugáltunk 10 percig. A perifériás vér limfocitákat tartalmazó sejtpelleteket -20 °C-on tároltuk. A felülúszókat ismét centrifugáltuk 10 000 g-vel 10 percig, majd a plazmát összegyűjtöttük, és -80 °C-on tároltuk. Tiangen teljes vér DNS Kit-et (Tiangen, Peking, PRC) használtunk a DNS kivonására a perifériás vér limfocitáiból. QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit-et (Qiagen, német) használtunk a cfDNS plazmából történő extrahálására. Az összes készletet a gyártó utasításai szerint használták.

Könyvtár előkészítése és szekvenálása: Minden minta esetében a DNS mennyiségét a Qubit dsDNA HS Assay kit (Life Technologies, USA) segítségével határoztuk meg, mint a gyártó által javasolt protokollt. A célzott amplifikációt és az Illumina adapterrel ligált könyvtár-előkészítést Amplicon Sequencing-Illumina Compatible Kit segítségével végeztük a gyártó utasításait követve (Questgenomics, Nanjing, PRC). Minden mintát Illumina HiSeq X-Ten-nek vetettünk alá a páros végű szekvenáláshoz (150 bp mindkét végén). Az AmpliSeq Cancer Panel 1406 rákkal kapcsolatos gént fed le, amelyeket a Co. Roche fejlesztett ki.

Változathívás: A HiSeq X-Ten kezdeti adatait fastQC (v0.11.3) segítségével értékeltük ki. A nyers leolvasásokat BWA (0.7.12-r1039) segítségével a hg19 referenciagenomhoz térképeztük fel. A Samtools és a VarScan (v2.4.1) programot használtuk a változatok hívására: (1) az átlagos teljes lefedettség >1000, és az egyes változatok lefedettsége >10; a nevezett variánshoz legalább egy mintát, amelynek variáns gyakorisága >1%, minden minta variáns gyakorisága >0,5%, és P érték

Statisztikai elemzés: A 0,5%-nál kisebb variánsgyakoriság esetén a 0 helyett 0 lett. Az R-t (hclust, v3.2.4) használtuk a variáns gyakorisági klaszterezési elemzéshez, hogy megmutassuk, milyen típusú rákos betegekből származó minták hasonlítanak jobban. Student-féle T-tesztet alkalmaztunk a cfDNS-koncentráció és a p

Tanulmány típusa

Megfigyelő

Beiratkozás (Várható)

200

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi kapcsolat

Tanulmányi helyek

  • Kína
    • Fujian
      • Fuzhou, Fujian, Kína, 350014
        • Rongbo Lin

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

  • Gyermek
  • Felnőtt
  • Idősebb felnőtt

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Tanulmányozható nemek

Összes

Mintavételi módszer

Valószínűségi minta

Tanulmányi populáció

III/IV stádiumú gyomor-bélrendszeri rák

Leírás

Bevételi kritériumok:

  • patológiásan igazolt III/IV. stádiumú gyomor-bélrendszeri daganatos betegek
  • minden beteg nem kapott kemoterápiát

Kizárási kritériumok:

-

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

  • Megfigyelési modellek: Kohorsz
  • Időperspektívák: Leendő

Kohorszok és beavatkozások

Csoport / Kohorsz
Beavatkozás / kezelés
Előrehaladott gyomor-bélrendszeri daganat
200, kórosan igazolt, előrehaladott gyomor-bélrendszeri daganatos beteg, akiket soha nem kezeltek kemoterápiával a Fujian Cancer Hospitalban
Diagnosztikai vizsgálat: Eszköz: NGS szekvenáló cfDNS
NGS szekvenálás cfDNS és Tumor Burden

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
cfDNS
Időkeret: 6 hónap
bemutatja a cfDNS-elváltozások/profilozás spektrumát
6 hónap

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Tumor mutációs teher
Időkeret: 6 hónap
bemutatja a tumormutációs teher változásait/profilozását
6 hónap

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Szponzor

Fujian Cancer Hospital

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Várható)

2018. július 1.

Elsődleges befejezés (Várható)

2020. december 31.

A tanulmány befejezése (Várható)

2020. december 31.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2018. március 18.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2018. március 18.

Első közzététel (Tényleges)

2018. március 23.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)

2018. július 2.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2018. június 28.

Utolsó ellenőrzés

2018. június 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Kulcsszavak

További vonatkozó MeSH feltételek

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • FNF-009

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

az Egyesült Államokban gyártott és onnan exportált termék

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Klinikai vizsgálatok a Emésztőrendszeri rák

Klinikai vizsgálatok a Eszköz: NGS szekvenáló cfDNS

Keressen hasonló próbaverziókban

Szponzorok és közreműködők

Egészségi állapot

Kábítószer-beavatkozások

CROs by country

CROs in Czech Republic

Körülmények

Ritka betegségek

Kábítószer-beavatkozások

Táplálék-kiegészítők

Szponzor / közreműködők

Helyek

3
Iratkozz fel