Uno studio per esaminare il valore dell'ampio test del pannello di sequenziamento agnostico di nuova generazione (NGS) rispetto all'NGS rimborsato diretto dagli organi: uno studio di precisione belga del BSMO in collaborazione con il Centro per il cancro

Titolo dello studio Uno studio per esaminare il valore di un ampio panel di test NGS agnostici rispetto a NGS diretto agli organi rimborsato: uno studio belga di precisione del BSMO in collaborazione con il Cancer Center Numero dello studio BSMO 2020-1 Fase di studio Sponsor esplorativo Belgian Society of medical Oncologia (BSMO) Trattamento Nessuno Contesto e motivazione Diversi farmaci mirati a prodotti genici mutati nelle cellule tumorali sono disponibili per i pazienti belgi attraverso il rimborso dei farmaci e, presto, mediante test genomici organo-specifici rimborsati.

Questo contesto è sfavorevole per quanto riguarda le seguenti questioni:

1. Molti altri farmaci con solide motivazioni scientifiche e prove precliniche sono disponibili attraverso studi clinici. I geni pertinenti non sono generalmente inclusi nell'NGS rimborsato e l'identificazione ad hoc di tali pazienti è estremamente difficile e quindi ostacola gravemente l'arruolamento in tali studi. Ciò nega ai pazienti un potenziale accesso a trattamenti innovativi di cui potrebbero beneficiare e ostacola il progresso.
2. Gli stessi geni possono essere mutati in altri tipi di cancro, diversi dal contesto rimborsato, ma non vengono rilevati a causa dell'approccio organo-specifico nell'NGS rimborsato. L'esame di questi geni con un approccio agnostico darebbe a questi altri pazienti un potenziale accesso ai farmaci (attraverso varie vie, inclusi studi clinici o necessità mediche o altro)
3. I pannelli più ampi applicati da alcune piattaforme belghe (50-100 geni), a volte in un approccio agnostico, non coprono tutti i geni potenzialmente utilizzabili o non tutti i tipi di varianti utilizzabili in questi geni.
4. I riarrangiamenti che sono altamente attuabili non sono sistematicamente coperti dai test NGS, ma si basano sull'immunoistochimica (se eseguita) dei test dei pannelli di fusione che richiedono finanziamenti aggiuntivi.
5. I vari laboratori NGS belgi utilizzano metodologie accreditate ma eterogenee ed è stato riportato che il tasso di rilevamento di alcune mutazioni varia da un sito all'altro.

Pertanto, dal punto di vista del paziente e dell'oncologo, esistono carenze attuali che mettono a repentaglio l'accesso ottimale dei pazienti alle attuali o nuove terapie guidate dal genoma. L'identificazione errata dei pazienti sensibili limita l'attuazione delle sperimentazioni cliniche ei relativi tassi di acquisizione e quindi l'attrattiva del Belgio per tali sperimentazioni.

Esistono piattaforme commerciali più complete che coprono un ampio set di geni utilizzabili (fino a centinaia di geni) e i vari tipi di mutazioni in questi geni: mutazioni di sequenza, riarrangiamenti, risultanti in geni di fusione e amplificazioni geniche.

Questi fornitori commerciali dispongono di una metodologia completa adeguata, ma sono troppo costosi (ai loro attuali prezzi pubblici) per un'applicazione generale. Uno di questi è la piattaforma di Foundation Medicine che si basa su una vasta esperienza nell'annotazione delle varianti negli Stati Uniti e include probabilmente tutti gli attuali obiettivi perseguibili tra cui mutazioni genetiche, fusioni, MSI e TMB, tutto in una volta in un unico risultato. Riferiscono inoltre l'azionabilità e le opzioni di trattamento consolidate o sperimentali cliniche.

Per gli oncologi questo è molto allettante rispetto alle attuali condizioni di rimborso frammentate, sequenziali e molto limitate.

Gli investigatori stimano che fino al 20% dei malati di cancro avanzato potrebbe avere accesso a trattamenti basati sul genotipo che non sono coperti dall'accesso basato sul rimborso basato sugli organi a NGS. Ciò può avvenire sotto forma di applicazione off-label di farmaci rimborsati, studi di sviluppo di farmaci sponsorizzati da farmaci che affrontano un genotipo specifico o studi di basket accademici o sponsorizzati da farmaci. Senza ampi test agnostici, l'identificazione dei pazienti idonei rimane estremamente difficile. Uno studio recente [Uno studio sulle caratteristiche genetiche e l'idoneità per il trattamento mirato del cancro (TARGET)] ha mostrato che il tasso di rilevamento di mutazioni attuabili è aumentato dal 28% con i test locali al 66% con i test della Foundation Medicine.

Obiettivi

1. Determinare il valore aggiunto dell'NGS completo e agnostico rispetto alla pratica del "mondo reale" ("pratica del mondo reale" significa test locali, nessun rimborso per i test locali e/o nessuna lesione metastatica accessibile) nel fornire ai pazienti con tumori solidi avanzati/metastatici accedere alla terapia molecolare guidata e/o all'immunoterapia sulla base dei risultati genomici.
2. Descrivere il panorama delle alterazioni genomiche rilevate da NGS rimborsate
3. Descrivere il panorama delle alterazioni genomiche rilevate da panel test completi
4. Valutare il successo tecnico di panel test completi
5. Descrivere l'adozione dei trattamenti raccomandati dal comitato dei tumori molecolari guidato dai test genomici.