Tanulmány a széles körű agnosztikus következő generációs szekvenálás (NGS) panelteszt értékének vizsgálatára a kompenzált, szerv által irányított NGS-sel szemben: a BSMO belga precíziós tanulmánya a Rákkutató Központtal együttműködésben

A tanulmány címe Egy tanulmány a széles körű agnosztikus NGS panelteszt értékének vizsgálatára a kompenzált, szervre irányított NGS-sel szemben: a BSMO belga precíziós vizsgálata a Cancer Center Study Number BSMO 2020-1 vizsgálati szakasz feltáró szponzorával, a Belga Orvosi Társasággal együttműködésben Onkológiai (BSMO) kezelés Nincs Háttér és indoklás Számos, a rákos sejtekben mutált géntermékeket célzó gyógyszer elérhető a belga betegek számára a gyógyszerek árának térítésével, illetve hamarosan térítéses szervspecifikus genomi vizsgálattal.

Ez a kontextus a következő kérdések tekintetében kedvezőtlen:

1. A klinikai vizsgálatok során számos további gyógyszer áll rendelkezésre szilárd tudományos érvekkel és preklinikai bizonyítékokkal. A releváns gének általában nem szerepelnek a visszatérített NGS-ben, és az ilyen betegek ad hoc azonosítása rendkívül nehéz, és így súlyosan hátráltatja az ilyen vizsgálatok során történő elhatárolást. Ez megtagadja a betegektől az olyan innovatív kezelésekhez való hozzáférést, amelyekből hasznot húzhatnak, és hátráltatja a fejlődést.
2. Ugyanezek a gének más ráktípusokban is mutálódhatnak, a térítéses kontextustól eltérően, de a támogatott NGS szervspecifikus megközelítése miatt nem mutathatók ki. E gének agnosztikus megközelítéssel történő vizsgálata lehetőséget adna ezeknek a betegeknek a gyógyszerekhez való hozzáférésre (különböző utakon, beleértve a klinikai vizsgálatokat vagy az orvosi szükségleteket vagy más módon).
3. Az egyes belga platformok által alkalmazott szélesebb panelek (50-100 gén), néha agnosztikus megközelítésben, nem fedik le az összes potenciálisan beavatható gént vagy nem minden típusú akcióképes változatot ezekben a génekben.
4. Az NGS-tesztek szisztematikusan nem foglalkoznak a nagymértékben végrehajtható átrendezésekkel, hanem a fúziós panelek immunhisztokémiáján (ha egyáltalán megtörtént) támaszkodnak, amely további finanszírozást igényel.
5. A különböző belga NGS-laboratóriumok akkreditált, de heterogén módszertant alkalmaznak, és arról számoltak be, hogy egyes mutációk kimutatási aránya helyről a másikra változik.

Ezért a betegek és az onkológusok szempontjából vannak olyan jelenlegi hiányosságok, amelyek veszélyeztetik a betegek optimális hozzáférését a jelenlegi vagy új, genomvezérelt terápiákhoz. Az érzékeny betegek hibás azonosítása korlátozza a klinikai vizsgálatok végrehajtását és azok felhalmozási arányát, és ezáltal Belgium vonzerejét az ilyen vizsgálatok szempontjából.

Léteznek átfogóbb kereskedelmi platformok, amelyek a működésbe lépő gének nagy halmazát (akár több száz gént) és az ezekben a génekben előforduló különböző típusú mutációkat fedik le: szekvenciamutációk, átrendeződések, amelyek fúziós géneket eredményeznek, és génamplifikációk.

Ezek a kereskedelmi szállítók megfelelő átfogó módszertannal rendelkeznek, de túl drágák (jelenlegi nyilvános áraik mellett) az általános alkalmazáshoz. Ezek egyike a Foundation Medicine platformja, amely az Egyesült Államokban szerzett nagy tapasztalatokra épít a variáns annotáció terén, és magában foglalja valószínűleg az összes aktuális célpontot, beleértve a génmutációkat, a fúziókat, az MSI-t és a TMB-t, mindezt egyszerre egy eredményben. Beszámolnak továbbá a végrehajthatóságról és a megalapozott vagy klinikai vizsgálati kezelési lehetőségekről.

Az onkológusok számára ez nagyon vonzó a töredezett, egymást követő és nagyon korlátozott jelenlegi térítéses feltételekhez képest.

A kutatók becslése szerint az előrehaladott daganatos betegek akár 20%-a is hozzájuthat olyan genotípus-alapú kezeléshez, amelyre nem vonatkozik a szervalapú térítéses NGS-hozzáférés. Ez történhet a támogatott gyógyszerek címkén kívüli alkalmazása, a gyógyszerekkel szponzorált gyógyszerfejlesztési kísérletek formájában, amelyek egy adott genotípusra vonatkoznak, vagy a gyógyszerekkel szponzorált vagy tudományos kosárkísérletek formájában. Széleskörű agnosztikus tesztelés nélkül továbbra is rendkívül nehéz a jogosult betegek azonosítása. Egy közelmúltbeli tanulmány [A genetikai jellemzők és a célzott rákkezelésre való alkalmasság vizsgálata (TARGET)] kimutatta, hogy a működőképes mutációk kimutatásának aránya a helyi teszteléssel 28%-ról 66%-ra nőtt a Foundation Medicine teszttel.

Célok

1. Az átfogó és agnosztikus NGS hozzáadott értékének meghatározása a "valódi" gyakorlattal szemben (a "valós világ" gyakorlat helyi tesztelést jelent, a helyi tesztelés költségének hiányát és/vagy nem hozzáférhető metasztatikus elváltozást) az előrehaladott/metasztatikus szolid daganatos betegek ellátásában a genomikai eredmények alapján hozzáférhet a molekuláris irányított terápiához és/vagy immunterápiához.
2. Leírni a visszatérített NGS által észlelt genomiális elváltozások tájképét
3. Az átfogó panelteszttel kimutatott genomiális elváltozások tájképének leírása
4. Az átfogó paneltesztelés technikai sikerének felmérése
5. A molekuláris tumortábla által javasolt kezelések felvételének ismertetése a genomiális vizsgálattal vezérelve.