Prospektywne badanie prognostycznej i predykcyjnej roli krążących komórek nowotworowych u pacjentów z rakiem płaskonabłonkowym jamy ustnej i gardła: CTCO (krążące komórki nowotworowe w części ustnej gardła) (CTCO)

Raki głowy i szyi (HNSCC) to przede wszystkim raki płaskonabłonkowe reprezentowane przez guzy górnego odcinka przewodu pokarmowego. Etapy zaawansowane lokalnie (stadium III i IV) stanowią od 50 do 70% wszystkich prezentacji. Trzy główne czynniki ryzyka to palenie, alkohol i zakażenie jamy ustnej i gardła wirusem brodawczaka ludzkiego (HPV).

Poza statusem HPV nie ma biomarkera rokowania u pacjentów z HSNCC. Krążące komórki nowotworowe (CTC) mogą dostarczać informacji „w czasie rzeczywistym” na temat zachowania guza i są już stosowane w różnych nowotworach (okrężnicy, płuc). Ich wykrywanie ma ograniczoną czułość, a biomarkery nie mogą być wykorzystywane do wczesnej diagnozy, ale mogą być przydatne podczas obserwacji w celu oceny miejscowej, regionalnej lub przerzutowej wczesnej wznowy nowotworu.

Używając próbek krwi w różnych momentach (w chwili rozpoznania, po początkowym leczeniu i podczas obserwacji), będziemy w stanie zmierzyć zmienność w oznaczaniu ilościowym i ustalić predykcyjną rolę tych CTC dla odpowiedzi na leczenie.

Naszą hipotezą jest, że CTC mogą odgrywać kluczową rolę, oprócz badania klinicznego i radiologicznego, w wykrywaniu wczesnego nawrotu nowotworu.

Wierzymy, że wspólne rozważenie parametrów klinicznych, strategii leczenia i kwantyfikacji CTC może zoptymalizować obserwację pacjentów i zarządzanie.

System ekstrakcji CTC, ClearCell® FX firmy Biolidics, jest zautomatyzowanym mikroprzepływowym systemem wzbogacania. Ma tę zaletę, że odzyskuje w pełni nienaruszone i zdolne do życia CTC ze standardowej próbki krwi. Delikatna zasada sortowania pozwala zachować integralność komórek, a tym samym ekspresję antygenów powierzchniowych. Wyizolowane w ten sposób CTC można następnie ponownie hodować lub analizować przez barwienie immunologiczne. Ta wysokowydajna technika, działająca od grudnia 2017 r. w Zakładzie Biochemii Pr Claire Rodriguez-Lafrasse (HCL), wykazała swoją przydatność w leczeniu raka płuc.

Analizę transkryptomiczną CTC można przeprowadzić w skali komórki po wyizolowaniu CTC. CTC można następnie sekwencjonować w RNAseq w masie (pula komórek) lub komórka po komórce na naszym sekwenatorze Illumina (Nextseq), w celu określenia heterogeniczności guza. Analiza transkryptomu dostarcza następnie informacji o stanie komórki pod względem jej pozycji w przejściu nabłonkowo-mezenchymalnym dzięki sygnaturze molekularnej według fenotypu. Charakterystyka bez a priori jest zatem możliwa dzięki pojedynczej komórce RNAseq. Ta wysoce czuła i innowacyjna technika pozwoli na badanie profilu ekspresji genów CTC.