Att fylla viktiga forskningsluckor med kliniska implikationer vid mansonellos och skistosomiasis: en nätverksansats

Övrig: Biologiska prover

M. perstans microfilariae och Schistosoma spp ägg, erhållna från rutindiagnostiska procedurer som utförs på patienter, särskilt migranter och resenärer, som besöktes i de centra som deltar i denna studie

Diagnostiskt test: Molekylärbiologiska analyser

Prover av M. perstans microfilariae kommer att bearbetas med PCR för att undersöka närvaron (eller frånvaron) av Wolbachia med hjälp av en uppsättning primers riktade mot generna ftsZ och 16S och optimeras med hjälp av referensmaterial under studiens första år. Prover av Schistosoma-ägg från urin och avföring kommer att bearbetas för DNA-extraktion. Varje prov kommer att karakteriseras genetiskt genom multilokusanalys av mitokondriella cox1-regionen och de nukleära ITS- och 18S-rRNA-regionerna. PCR-produkter kommer att analyseras med agarosgelelektrofores och utvalda amplikoner kommer att renas och Sanger-sekvenseras. För individualisering av Schistosoma-hybrider kommer kärn-DNA för varje prov att bekräftas genom analys av de artspecifika polymorfa positionerna för ITS1+2 och 18S. De mitokondriella och nukleära DNA-genetiska profilerna för varje enskilt prov kommer att registreras för att bestämma arterna som är involverade i infektionerna och även eventuella hybridschistosomer

Antal M. perstans microfilariae

Antal prover, definierat som hela M. perstans microfilariae som hämtats från ett blodprov från varje patient, positivt för närvaron av Wolbachia enligt PCR.

Andel M. perstans microfilariae

Procentandel av prover, definierade som hela M. perstans microfilariae hämtade från ett blodprov från varje patient, positivt för närvaron av Wolbachia enligt PCR.

Antal Schistosoma ägg

Antal prover definierat som hela Schistosoma-ägg som hämtats från ett avförings- eller urinprov från varje patient, positivt för förekomsten av Schistosoma-hybridarter.

Andel Schistosoma ägg

Procentandel av prover definierade som hela Schistosoma-ägg som hämtats från ett avförings- eller urinprov från varje patient, positivt för förekomsten av Schistosoma-hybridarter.

Antal prover positiva för Wolbachia

antal prover, definierat som hela M. perstans microfilariae som hämtats från ett blodprov från varje patient, positivt för närvaron av Wolbachia enligt PCR, efter patientens ursprungsland eller mest troligt infektionsland.

Andel prover positiva för Wolbachia

Procentandel av prover, definierade som hela M. perstans microfilariae som hämtats från ett blodprov från varje patient, positivt för närvaron av Wolbachia enligt PCR-bedömning, efter patientens ursprungsland eller mest troligt infektionsland.

Antal prover som är positiva för Schistosoma hybridarter

antal prover definierat som hela Schistosoma-ägg som hämtats från ett avförings- eller urinprov från varje patient, positivt för förekomsten av Schistosoma-hybridarter efter patientens ursprungsland eller mest troligt infektionsland.

Procentandel positiva prover för Schistosoma-hybridarter

procent av prover definierade som hela Schistosoma-ägg som hämtats från ett avförings- eller urinprov från varje patient, positiva för förekomsten av Schistosoma-hybridarter efter patientens ursprungsland eller mest troligt infektionsland.

Identifiering av hybridarter av Schistosoma spp.

Identifiering av hybridarter från varje föräldraart av Schistosoma spp.