Optimalisering av sepsisterapi basert på pasientspesifikk digital presisjonsdiagnostikk (DigiSep)

Sepsis er en sykdom som utløses av en infeksjon og representerer en av de største utfordringene ved moderne intensivmedisin. Med hensyn til målrettet antimikrobiell behandling er tidligst mulig patogendeteksjon av avgjørende betydning. Til nå har kulturbaserte deteksjonsmetoder representert gullstandarden for diagnose, selv om mange begrensninger kjennetegner disse. I denne sammenheng er kulturuavhengige molekylærbiologiske prosesser et alternativ. Konseptet med serumdeteksjon av sirkulerende, fritt DNA ved bruk av neste generasjons sekvensering (NGS) ser ut til å representere en lovende diagnostisk prosedyre hos pasienter med blodbaneinfeksjoner. Søkerens omfattende forarbeid tyder på at NGS-basert diagnostikk ved bruk av SIQ-skåren har høyere spesifisitet og sensitivitet sammenlignet med tradisjonelle kulturbaserte metoder for å påvise blodbaneinfeksjoner. Dette forarbeidet for DigiSep-studien ved hjelp av intervensjonsstudiedesign gir det optimale grunnlaget for å etablere dette nye konseptet som en del av den nasjonale standarden basert på best mulig bevis. DigiSep-studien er ment å karakterisere effekten av kombinasjonen av digital presisjonsdiagnostikk, ekspertutveksling og kulturbasert standarddiagnostikk sammenlignet med en ren kulturbasert konvensjonell diagnose i det kliniske bildet av sepsis/septisk sjokk. Studien undersøker hos 410 pasienter (n = 205 per arm) med sepsis / septisk sjokk om den såkalte DOOR-RADAR-skåren (Desirability of Outcome Ranking / Response Adjusted for Duration of Antibiotic Risk Score) kan forbedres betydelig, ved bruk av NGS. Vi tar også sikte på å også undersøke om den nye prosedyren er kostnadseffektiv. Det er postulert at innleggelsestid, dødelighet, forekomst av akutt nyresvikt (ARF), varigheten av antimikrobiell behandling samt kostnader til komplikasjoner og poliklinisk ettervern kan reduseres. Det kan også forventes en betydelig forbedring av livskvaliteten til de berørte pasientene.

Som en del av studien samles de essensielle dataene inn én gang ved tidspunktet for sepsis (= debut). Den kulturbaserte diagnostikken inkluderer den retningslinjeorienterte samlingen av 2 blodkultursett (2 x aerobic / 2 x anaerobic) til oppstart og tre dager senere. Samtidig innhentes serumprøver for NGS-basert patogendiagnostikk. Ytterligere prøvetaking for NGS-basert diagnostikk kan gjøres frem til dag 14 etter debut eller når den behandlende legen etablerer en klinisk indikasjon for innsamling av ytterligere blodkulturer. De nevnte kulturene vs NGS-basert patogendiagnostikk er også ledsaget av utvidet immunologisk overvåking fra blodplasmaprøver samt en NGS-basert transkriptomanalyse. Den assosierte prøvetakingen finner sted ved debut, 3, 7 og 14 dager etter begynnelsen av sepsis. Rutinemessige mikrobiologiske funn fra andre biologiske prøver (f. kirurgiske vattpinner, dreneringssekret, trakealsekret, vevsprøver) inngår i vurderingen dersom disse er tatt tre dager før eller etter uttak av serumprøver for NGS-basert diagnostikk. Den kliniske datainnsamlingen utføres også på tidspunktet for sepsis (= debut), 3, 7 og 14 dager senere, analogt med den ovenfor nevnte prøveinnsamlingen. Den endelige utfallsevalueringen finner sted 28 dager (= 28 d) etter oppstart av sepsis. Den studierelaterte belastningen på den enkelte studiepasient inkluderer totalt 17 ml fullblod for NGS-basert diagnostikk, de fire prøvene på 7,5 ml fullblod for immunologisk overvåking og de fire prøvene på 2,7 ml fullblod for transkriptomanalyse . Det minste totale volumet utgjør derfor oppsamling av ca. 75 ml fullblod i løpet av de første 14 dagene etter sepsisstart. Prøvetakingen skjer med innsamling av blodkulturene eller innenfor rammen av de daglige rutinemessige blodprøvene slik at det ikke er behov for ytterligere venepunkteringer her. Infeksjonsparametere som prokalsitonin (PCT) utføres innenfor rammen av daglig regelmessig blodprøvetaking og krever derfor ingen ekstra vaskulære punkteringer. Det samme prinsippet gjelder for innsamling av blodkulturer som rutinemessig innhentes som en del av standard diagnostikk hos pasienter med mistenkt eller påvist sepsis. De nødvendige blodprøvene på to 40 ml fullblod (hvert to sett med 2 x aerob / 2 x anaerob = 4 x 10 ml = 40 ml) representerer derfor ingen ekstra belastning på grunn av studien. En ytterligere ekstra belastning for pasienten vedrørende invasive prosedyrer eller undersøkelser forventes ikke i studien.