Sepsiksen hoidon optimointi potilaskohtaisen digitaalisen tarkkuusdiagnosiikan perusteella (DigiSep)

Sepsis on infektion laukaisema sairaus, joka on yksi nykyaikaisen tehohoidon suurimmista haasteista. Kohdennettujen mikrobilääkkeiden hoidon kannalta taudinaiheuttajien mahdollisimman varhainen havaitseminen on ratkaisevan tärkeää. Tähän asti viljelyyn perustuvat havaitsemismenetelmät ovat diagnoosin kultainen standardi, vaikka niille on ominaista lukuisia rajoituksia. Tässä yhteydessä kulttuurista riippumattomat molekyylibiologiset prosessit ovat vaihtoehto. Erityisesti käsite kiertävän, vapaan DNA:n seerumin havaitsemisesta seuraavan sukupolven sekvensoinnin (NGS) avulla näyttää edustavan lupaavaa diagnostista menettelyä potilailla, joilla on verenkiertoinfektioita. Hakijan laaja valmistelutyö viittaa siihen, että NGS-pohjainen SIQ-pistemäärää käyttävä diagnostiikka on spesifisempi ja herkempi verrattuna perinteisiin viljelypohjaisiin verenkiertoinfektioiden havaitsemismenetelmiin. Tämä interventiotutkimussuunnittelun avulla tehty DigiSep-tutkimuksen esityö tarjoaa optimaalisen pohjan tämän uuden konseptin vakiinnuttamiseksi osaksi kansallista standardia parhaaseen mahdolliseen näyttöön perustuen. DigiSep-tutkimuksen tarkoituksena on karakterisoida digitaalisen tarkkuusdiagnostiikan, asiantuntijavaihdon ja viljelypohjaisen standardidiagnostiikan yhdistelmän vaikutusta puhtaasti viljelypohjaiseen perinteiseen diagnoosiin sepsiksen/septisen shokin kliinisessä kuvassa. Tutkimuksessa tutkitaan 410 potilaalla (n = 205 per käsi), joilla on sepsis/septinen shokki, voidaanko ns. DOOR-RADAR-pisteitä (Desirability of Outcome Ranking / Response Adjusted for Duration of Antibiotic Risk Score) parantaa merkittävästi soveltamalla NGS. Pyrimme myös selvittämään uuden menettelyn kustannustehokkuutta. Oletetaan, että sairaalahoitoon pääsyaikaa, kuolleisuutta, akuutin munuaisten vajaatoiminnan (ARF) ilmaantuvuutta, antimikrobisen hoidon kestoa sekä komplikaatioiden ja avohoidon kustannuksia voidaan vähentää. Myös sairastuneiden potilaiden elämänlaadun merkittävää paranemista voidaan odottaa.

Osana tutkimusta olennaiset tiedot kerätään kerran sepsiksen (= puhkeamisen) yhteydessä. Viljelypohjaiseen diagnostiikkaan kuuluu ohjeiden mukainen 2 veriviljelysarjan (2 x aerobinen / 2 x anaerobinen) kerääminen alkuun ja kolme päivää myöhemmin. Samalla otetaan seeruminäytteitä NGS-pohjaista taudinaiheuttajadiagnostiikkaa varten. Lisänäytteitä NGS-pohjaista diagnostiikkaa varten voidaan ottaa 14 päivään asti aloittamisen jälkeen tai aina, kun hoitava lääkäri vahvistaa kliinisen indikaation lisäveriviljelmien keräämiselle. Edellä mainittuihin viljelmiin vs. NGS-pohjaiseen patogeenien diagnostiikkaan liittyy myös laajennettu immunologinen seuranta veriplasmanäytteistä sekä NGS-pohjainen transkriptianalyysi. Tähän liittyvä näytteenotto tapahtuu sepsiksen alkaessa, 3, 7 ja 14 päivää sepsiksen alkamisen jälkeen. Rutiininomaiset mikrobiologiset löydökset muista biologisista näytteistä (esim. kirurgiset pyyhkäisynäytteet, vedenpoistoeritteet, henkitorven eritteet, kudosnäytteet) sisällytetään arviointiin, jos ne on kerätty kolme päivää ennen tai sen jälkeen, kun NGS-pohjaista diagnostiikkaa varten on otettu seeruminäytteitä. Kliinisen tiedon keruu suoritetaan myös sepsiksen (= puhkeamisen) hetkellä, 3, 7 ja 14 päivää myöhemmin, analogisesti edellä mainitun näytteenoton kanssa. Lopputuloksen arviointi tapahtuu 28 päivää (= 28 päivää) sepsiksen alkamisen jälkeen. Yksittäisen tutkimuspotilaan tutkimukseen liittyvä taakka sisältää yhteensä 17 ml kokoverta NGS-pohjaiseen diagnostiikkaan, neljä 7,5 ml:n kokoverenäytettä immunologiseen seurantaan ja neljä 2,7 ml:n kokoverenäytettä transkriptioanalyysiin. . Minimikokonaistilavuus vastaa näin ollen noin 75 ml:n kokoverta keräämistä ensimmäisten 14 päivän aikana sepsiksen alkamisesta. Näytteenotto tapahtuu veriviljelmien keruun yhteydessä tai päivittäisten rutiiniverinäytteiden puitteissa, jotta tässä ei tarvita muita laskimopunktioita. Infektioparametrit, kuten prokalsitoniini (PCT), suoritetaan päivittäisen säännöllisen verenkeräyksen puitteissa, joten ne eivät vaadi ylimääräisiä verisuonipunktioita. Sama periaate koskee veriviljelmien keräämistä, jotka otetaan rutiininomaisesti osana standardidiagnostiikkaa potilailta, joilla on epäilty tai todettu sepsis. Vaaditut kahden 40 ml:n kokoveren näytteet (kumpikin kaksi sarjaa 2 x aerobista / 2 x anaerobista = 4 x 10 ml = 40 ml) eivät siis muodosta lisätaakkaa tutkimuksesta johtuen. Tutkimuksessa ei odoteta aiheuttavan lisätaakkaa potilaalle invasiivisista toimenpiteistä tai tutkimuksista.