Optymalizacja terapii sepsy w oparciu o dostosowaną do pacjenta cyfrową diagnostykę precyzyjną (DigiSep)

Sepsa jest chorobą wywoływaną przez infekcję i stanowi jedno z największych wyzwań współczesnej medycyny intensywnej terapii. W odniesieniu do celowanej terapii przeciwdrobnoustrojowej kluczowe znaczenie ma jak najwcześniejsze wykrycie patogenu. Do tej pory metody wykrywania oparte na hodowli stanowią złoty standard w diagnostyce, chociaż charakteryzują się one licznymi ograniczeniami. W tym kontekście alternatywą są niezależne od kultury procesy biologii molekularnej. W szczególności koncepcja wykrywania krążącego, wolnego DNA w surowicy z wykorzystaniem sekwencjonowania nowej generacji (NGS) wydaje się stanowić obiecującą procedurę diagnostyczną u pacjentów z zakażeniami krwi. Szeroko zakrojone prace przygotowawcze wnioskodawcy sugerują, że diagnostyka oparta na NGS z wykorzystaniem wyniku SIQ ma wyższą specyficzność i czułość w porównaniu z tradycyjnymi metodami wykrywania zakażeń krwi opartymi na posiewach. Ta wstępna praca przed badaniem DigiSep z pomocą projektu badania interwencyjnego zapewnia optymalną podstawę do ustanowienia tej nowej koncepcji jako części standardu krajowego w oparciu o najlepsze możliwe dowody. Badanie DigiSep ma na celu scharakteryzowanie wpływu połączenia precyzyjnej diagnostyki cyfrowej, wymiany ekspertów i standardowej diagnostyki opartej na posiewie w porównaniu z konwencjonalną diagnostyką opartą wyłącznie na hodowli w obrazie klinicznym sepsy/wstrząsu septycznego. Badanie dotyczy 410 pacjentów (n = 205 na ramię) z sepsą/wstrząsem septycznym, czy tzw. wynik DOOR-RADAR (ang. Desirability of Outcome Ranking / Response Adjusted for Duration of Antibiotic Risk Score) można znacząco poprawić, stosując NGS. Naszym celem jest również zbadanie, czy nowa procedura jest opłacalna. Postuluje się skrócenie czasu hospitalizacji, śmiertelności, częstości występowania ostrej niewydolności nerek (ARF), czasu trwania antybiotykoterapii oraz kosztów powikłań i opieki ambulatoryjnej. Można również spodziewać się znacznej poprawy jakości życia dotkniętych pacjentów.

W ramach badania podstawowe dane zbierane są jednorazowo w momencie wystąpienia sepsy (= początek). Diagnostyka oparta na hodowli obejmuje zorientowane na wytyczne pobranie 2 zestawów na posiew krwi (2 x tlenowy / 2 x beztlenowy) do początku i trzy dni później. Jednocześnie pobierane są próbki surowicy do diagnostyki patogenów metodą NGS. Dodatkowe pobieranie próbek do diagnostyki opartej na NGS można pobrać do 14 dnia od zachorowania lub zawsze wtedy, gdy lekarz prowadzący stwierdzi kliniczne wskazania do pobrania kolejnych posiewów krwi. Wspomnianej diagnostyce patogenów opartej na kulturach i NGS towarzyszy również rozszerzony monitoring immunologiczny z próbek osocza krwi oraz analiza transkryptomu oparta na NGS. Powiązane pobieranie próbek odbywa się w momencie wystąpienia posocznicy, 3, 7 i 14 dni po jej wystąpieniu. Rutynowe wyniki badań mikrobiologicznych z innych próbek biologicznych (np. wymazy chirurgiczne, wydzieliny drenażowe, wydzieliny z tchawicy, próbki tkanek) są uwzględnione w ocenie, jeżeli zostały one pobrane trzy dni przed lub po ekstrakcji próbek surowicy do celów diagnostyki opartej na NGS. Zbieranie danych klinicznych przeprowadza się również w czasie posocznicy (= początek), 3, 7 i 14 dni później, analogicznie do wyżej wspomnianego zbierania próbek. Ostateczna ocena wyniku ma miejsce 28 dni (= 28 dni) po wystąpieniu sepsy. Obciążenie związane z badaniem dla indywidualnego badanego pacjenta obejmuje łącznie 17 ml pełnej krwi do diagnostyki opartej na NGS, cztery próbki 7,5 ml pełnej krwi do monitorowania immunologicznego i cztery próbki 2,7 ml pełnej krwi do analizy transkryptomu . Minimalna całkowita objętość oznacza zatem pobranie około 75 ml pełnej krwi w ciągu pierwszych 14 dni od wystąpienia sepsy. Pobieranie próbek odbywa się wraz z pobieraniem posiewów krwi lub w ramach codziennych rutynowych prób krwi, dzięki czemu nie są tu wymagane dalsze nakłucia żylne. Parametry zakażenia, takie jak prokalcytonina (PCT), przeprowadzane są w ramach codziennego, regularnego pobierania krwi, dzięki czemu nie wymagają dodatkowych nakłuć naczyniowych. Ta sama zasada dotyczy pobierania posiewów krwi, które są rutynowo pobierane w ramach standardowej diagnostyki u pacjentów z podejrzeniem lub potwierdzoną sepsą. Wymagane próbki krwi z dwóch 40 ml pełnej krwi (każdy dwa zestawy 2 x tlenowe / 2 x beztlenowe = 4 x 10 ml = 40 ml) nie stanowią zatem żadnego dodatkowego obciążenia związanego z badaniem. W badaniu nie przewiduje się dodatkowego obciążenia pacjenta związanego z inwazyjnymi zabiegami lub badaniami.