Ihmisen immuunikatoviruksen (HIV) ja Cluster of Differentiation 8 (CD8) -soluimmuniteetin yhteissopeutuminen ("ImmunoCo27")

HIV-varastojen hävittämistä koskevien tutkimusten ja tehokkaiden rokotteiden kehittämistarpeen herättämien haasteiden tärkeys edellyttää paljon syvempää ymmärrystä molekyylimekanismeista, jotka säätelevät HIV:n ja sen yhteiskehitystä ja yhteissopeutumista. isäntänä taudin luonnollisen kulun ja hoidon aikana. Ainutlaatuinen solukokoelma, joka perustettiin 27 vuotta sitten ANRS-kohortissa (ImmunoCo) ja uudet ultrasyvään sekvensointimenetelmät, tai "seuraavan sukupolven sekvensointi", mahdollistavat innovatiivisen analyysin HIV:n vaihteluista ja varastoista sekä käytetyistä repertuaareista. CD8 T-soluvasteiden avulla tarjotakseen uusia näkemyksiä viruksen ja sen isännän välisistä erittäin pitkäaikaisista suhteista. Tavoitteena on edetä ennennäkemättömällä tasolla näiden mekanismien ymmärtämisessä tämän Immunoco-kohortin tarjoaman ainutlaatuisen mahdollisuuden ansiosta, joka alun perin koostui 152 HIV-tartunnan saaneesta potilaasta, joista suurin osa jäi hoitamatta, kun heidät värvättiin Pitié-Salpêtrièren sairaalaan vuosina 1991–97. Tässä sairaalassa seurattiin edelleen 28 henkilöä, joita hoidettiin tehokkaasti viimeiset 15 vuotta. ImmunoCo-kohortti oli alun perin perustettu tutkimaan sytotoksisten T-lymfosyyttien (CTL) vasteiden ominaisuuksia HIV:lle sairauden etenemisen yhteydessä. Tämä poikkeuksellinen ja edelleen saatavilla 1991-97 solukokoelma, joka on rikastettu ylimääräisillä näytteillä vuodesta 1988 nykypäivään, mahdollistaa retrospektiivisen pitkittäisanalyysin 27 vuoden ajalta niille 28 potilaalle, joita edelleen seurataan, ja uusi verinäyte vuonna 2016. Hankkeessa on mukana 5 erittäin kokenutta tiimiä ja tavoitteena on karakterisoida rinnakkain: 1) viruksen evoluutio ja virulenssia määrittävät virustekijät infektion etenemistä ennustavina markkereina suorittamalla ultrasyvä sekvensointi koko HIV-genomista ja vereen arkistoiduista virusvarianteista. mononukleaariset solut (PBMC) ja 2) PBMC:n säiliön kehitys ja niihin arkistoitujen varianttien jakautuminen ajan myötä suhteessa altistumiseen erilaisille selektiivisille paineille, jotka johtuvat CTL:stä tai antiretroviraalisesta hoidosta (ART), 3) HIV-vastaisten CD8 T-solujen yhteisevoluutio: hypoteesi on, että uusien CD8 T -klonotyyppien ilmaantuminen, jotka osoittavat suurta herkkyyttä varianttiantigeeneille tai ristireaktiivisuutta, joka pystyy tunnistamaan samalla tavalla villityypin ja mutanttiepitoopit, mahdollistaa tehokkaan pitkäaikainen viruksen replikaation kontrollointi ja että solujen katoaminen kloonaalisesta uupumuksesta liittyy taudin etenemiseen. Viruksen evoluution, isännän vasteiden ja virulenssin geneettisten determinanttien tunnistamisen koordinoidun tutkimuksen pitäisi auttaa ymmärtämään paremmin HIV:n patogeenisyyden mekanismeja ja mutaatioiden säilymistä virusvarastoissa, erityisesti viallisten mutanttien tai ART-resistenttien mutanttien osalta, sekä yhteissopeutumista. CD8-T-soluvalikoimasta ja viruksen vaihtelusta, joka määrittää anti-HIV-CD8-T-solujen viruskontrollikapasiteetit. Kaiken kaikkiaan näiden tulosten pitäisi avata uusia strategioita viruksen replikaation estämiseksi ja virusvarastojen hallitsemiseksi terapeuttisia ja rokotteita varten.