Klinisk anvendelse af high-throughput sekvenseringsteknologi til diagnosticering af patienter med svær infektion

Formålet med denne undersøgelse er at evaluere den kliniske værdi af high throughput sekventering af infektiøse patogener for patienter med svær infektion, og at etablere grundlag for high throughput sekventering som den kliniske rutinemæssige infektion patogen undersøgelse.

Denne undersøgelse er en diagnostisk undersøgelse, og stikprøven er på 320 tilfælde. 320 deltagere fra hæmatologisk afdeling og intensivafdeling, der opfylder inklusionskriterierne, er tilfældigt opdelt i kontrolgruppen og forsøgsgruppen med 160 tilfælde i hver gruppe. Både deltagerne i kontrolgruppen og forsøgsgruppen gennemgår rutinemæssige kliniske diagnosemetoder og behandling. Derudover opsamles deltagerne i den eksperimentelle gruppe prøverne inklusive fuldblod, cerebrospinalvæske eller alveolær skyllevæske, der kræves til højgennemstrømningssekventering af infektiøse patogener under prøveindsamling til rutinemæssig patogen undersøgelse af infektion. For forsøgsgruppens deltagere vil klinikerne udførligt bestemme opfølgende diagnosemetoder og behandling i henhold til de kliniske rutinemæssige infektionspatogentestresultater kombineret med resultaterne af high throughput sekventering af infektiøst patogen, mens kontrolgruppedeltagerne fortsætter med at gennemgå opfølgnings- op diagnosemetoder og behandling i henhold til resultaterne af den kliniske rutinemæssige infektionspatogenundersøgelse. Hvis resultaterne af højgennemstrømningssekvensering af infektiøse patogener i testgruppen er uoverensstemmende med resultaterne af klinisk rutinemæssig infektionspatogenundersøgelse, vil opfølgningsdiagnosen og behandlingen af ​​deltagerne være baseret på resultaterne af klinisk rutinemæssig infektionspatogenundersøgelse med prioritet .

Til prøvestørrelsesvurdering har vi forudsagt patogendiagnosehastigheden for rutinemæssige kliniske patogendetektionsmetoder og high-throughput sekventering af infektiøse patogener (α=0,05, β=0,10 (power=0,9)), i betragtning af, at den maksimale andel af manglende sager var 20%, og fik endelig prøveindholdet. Og denne undersøgelse vil omfatte alle emner udvalgt og randomiseret til et komplet analysesæt under intention-to-treat princippet. Efter at have ekskluderet deltagere med utilstrækkelig prøve, trukket sig fra forsøget midtvejs, opgivet behandlingen og forladt hospitalet, eller mistet til opfølgning, vil de resterende deltagere blive inkluderet i protokollen fastsat i henhold til protokolprincippet.

Hvad angår statistisk analyse, vil patogendiagnosehastigheden og den diagnostiske nøjagtighed mellem de konventionelle infektiøse patogentests og den høje gennemløbssekventering af infektiøse patogener blive sammenlignet i forsøgsgruppen. Ved at indsamle statistik over konsultationstimer og omkostningseffektivitet vil effekten af ​​high throughput sekventering af infektiøse patogener på diagnose og behandlingseffektivitet for forsøgsgruppen og kontrolgruppen blive sammenlignet, og gennem disse indikatorer vil klinisk anvendelsesværdi for diagnosticering af svær infektionspatienter ved high throughput sekventering af infektiøse patogener kan evalueres.