Mikrobiomin molekyylikarakterisointi (MMC)

Eturauhassyöpä on toiseksi yleisin pahanlaatuinen syöpä Iso-Britanniassa ja toiseksi yleisin miesten kuolleisuuden syy Isossa-Britanniassa. Androgeenideprivaatiohoito on edelleen hoidon tukipilari, ei vain edenneen eturauhassyövän hoidossa, vaan myös adjuvantti- ja neoadjuvanttiasetuksissa. Androgeenideprivaatiohoito indusoi remission 80–90 %:lla potilaista, joilla on pitkälle edennyt sairaus, ja sen etenemisvapaan eloonjäämisen mediaani on 12–33 kuukautta, jolloin yleensä ilmaantuu androgeenista riippumaton fenotyyppi. Tämä vastaa keskimäärin 23-37 kuukauden kokonaiseloonjäämistä androgeenipuutoksen alkamisesta.

Viimeaikaiset prekliiniset tutkimukset ovat osoittaneet, että suoliston mikrobiota liittyy hoitovasteeseen, kuten platinakemoterapiaan (oksaliplatiini) [1], syklofosfamidiin [2] ja sekä CTLA-4:n salpaukseen [3] että anti-PD-L1 [4] -immunohoitoihin. Kommensaalisen suolistoflooran hävittämisen antibioottihoidolla tai spesifisten patogeenivapaiden (SPF) ja/tai bakteerivapaiden eläinten avulla on osoitettu muuttavan näiden aineiden terapeuttista tehoa kasvainmalleissa. Mielenkiintoista on, että äskettäin tehty tutkimus melanoomamallilla osoitti, että vasteita anti-PD-L1-immunoterapialle voidaan lisätä syöttämällä eläimille Bifidobacterium-kantaa – joka on yleisesti käytetty probioottiravintolisissä – ennen hoidon aloittamista. Yhdessä nämä tutkimukset viittaavat siihen, että suoliston mikrobiomin koostumus on sekä välttämätön terapeuttiselle teholle että kohde, jota voitaisiin mahdollisesti muuttaa hoitovasteen parantamiseksi.

MMC on prospektiivinen, havainnollinen, monikeskustutkimus, jossa arvioidaan eturauhassyövän biologiaa ja siihen liittyvää mikrobiotaa.

Potilaiden on oltava valmiita ottamaan uusi kasvainbiopsia molekyylianalyysiä varten. MMC:n hyväksymisen jälkeen tuore kasvainkudos lähetetään nimettyihin tutkimuslaboratorioihin (katso laboratorion käsikirja) analyyseja varten molekyylipoikkeavuuksien ja dysbioosin tunnistamiseksi kohdistettujen tai laajempien molekyylianalyysien avulla (esim. exome, transkriptomi, koko genomi) sekä (jos osoitettu) ortogonaaliset analyysit (esim. immunohistokemia, immunofluoresenssi, RNAish, digitaalinen pisara-PCR). MMC keskittyy kasvainten ja mikrobiotan karakterisointiin (sekä CSPC että mCRPC), ja viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että tämä on erittäin heterogeeninen sairaus. Kerätyt tiedot ovat tarpeen mukaan potilaiden ja heidän kliinisen hoitotyöryhmän saatavilla, jotta he voivat valita, mitkä varhaisen kliinisen tutkimuksen vaihtoehdot kannattaa harkita.

Potilaat eivät saa mitään hoitoa tai IMP:tä osana tätä MMC-protokollaa. Molekyylien karakterisoinnin ja mikrobiotatutkimusten tulokset asetetaan hoitavan tutkijan ja potilaan saataville tutkimuskohtaisella käynnillä (puhelimitse tai kasvokkain); Tämän jälkeen potilaita seurataan 6 kuukauden välein lääkärinlausuntojen tai puhelimen avulla selviytymis- ja syöväntorjuntatietojen saamiseksi.